Magisterské studijní programy

Magisterský program je samostatný celek navazující na předchozí bakalářské studium na PřF JU nebo jiné vysoké škole. Standardní délka magisterského studia je dva roky. Součástí studia je vypracování diplomové práce. Studium je zakončeno státní závěrečnou zkouškou a obhajobou diplomové práce. Absolvent obdrží titul magistr (Mgr.).
Přijímací zkoušky do navazujícího magisterského studia mohou podstoupit pouze absolventi bakalářských studijních programů. Přijímací zkouška ověřuje úroveň znalostí potřebných pro zvolený obor. U odborného studia je její součástí také zkouška z anglického jazyka.

Magisterské studium pro budoucí středoškolské učitele

V navazujícím magisterském studiu Učitelství pro střední školy se posluchači zaměří především na didaktiku zvolených odborných předmětů, pedagogiku a psychologii a získání praktických dovedností ve školách. Systém studia učitelských oborů umožňuje od akademického roku 2008/2009 studovat libovolnou kombinaci dvou oborů nabízených na Přírodovědecké fakultě JU. Možné je také kombinovat některý ze studijních předmětů PřF JU s předměty z jiných fakult, např. tělesnou výchovou na Pedagogické fakultě, jazyky na Filozofické fakultě, apod. V současné době nabízí PřF JU následující magisterské obory v rámci výchovy učitelů pro střední školy:
Učitelství biologie pro střední školy
Učitelství fyziky pro střední školy
Učitelství  matematiky pro střední školy

Absolventi oborů budou kvalifikovaní středoškolští učitelé odborných předmětů v daného oboru.

Biofyzika

Magisterský program Biofyzika je dvouletý a navazuje na studium bakalářské. V jeho průběhu si posluchač prohloubí teoretické i experimentální znalosti v řadě dalších fyzikálních a biochemických disciplín, získá základní návky pro experimentální práci a prakticky se seznámí s širokým spektrem biofyzikálních měřících technik.
Absolventi oboru budou teoreticky a experimentálně připraveni pro práci jak v základním biofyzikálním výzkumu, tak v mnohooborových vědecko-výzkumných a aplikačních týmech pracujících v oblasti biologie, biotechnologií, ekologie a medicíny. Naleznou své uplatnění ve výzkumných a vědeckých institucích a ve zdravotnictví.

Botanika

zahrnuje 6 specializací
Systematika vyšších rostlin - klade důraz především na všestrannost poznání rostlin, včetně biochemie a genetiky.
Vegetační ekologie – je ekologie rostlin více prakticky zaměřená k posuzování stavu a vývoje porostů v produkčních i chráněných územích.
Bionomie sinic a řas – předmětem zkoumání oboru je taxonomie sinic a řas, ekologie planktonních řas a sinic, ekologie extrémních biotopů.
Archeobotanika – těžištěm specializace je propojování různých botanických analýz s historicko-archeologickým studiem krajiny, odhalování časového rozměru vegetačního krytu krajiny.
Mykologie – zaměřuje svou pozornost na houby v lesních ekosystémech, funkce mykorrhiz a reakce mykorrhizních systémů na člověkem vyvolané změny prostředí, dále na patogenní houby a rostlinnou patologii.
Ekologie populací a společenstev – se věnuje druhové diverzitě, a to jednak mechanismům, které koexistenci druhů v lučním společenstvu umožňují, a dále otázce, zda je fungování ekosystémů podmíněno jejich druhovou diverzitou.
Absolventi naleznou své uplatnění ve vědeckých institucích a školách v oboru botaniky včetně terénních a experimentálních botanických oborů, středních školách, orgánech ochrany přírody a státní správy. V zemědělském a lesnickém výzkumu a vodním hospodářství.

Biologie ekosystémů

Studium oboru poskytuje širší teoretický základ ekologie jako vědní disciplíny zabývající se vztahy mezi organismy navzájem a mezi organismy a jejich nejen stávajícím, ale i minulým a budoucím prostředím, a to na úrovni jedinců, populací i celých společenstev. Navazuje na bakalářský studijní program Biologie nebo Péče o životní prostředí.
zahrnuje 5 specializací
Ekologie - klade důraz na teorii oboru jako základ aplikací a je zaměřena především na vzájemné interakce organismů a jejich prostředí.
Hydrobiologie - se zabývá sladkovodními systémy, jejich analýzou biologickou i chemickou, interakcemi s okolím, popřípadě navrhuje způsoby úprav systémů žádoucím směrem a sledováním vývoje po úpravách.
Půdní biologie  - sleduje interakce mezi půdní zvířenou, mikrobiálním společenstvem, půdní strukturou a chemickými parametry, obor je základem studia úrodnosti půd.
Aplikovaná ekologie - připravuje posluchače pro práci v úřadech státní správy a samosprávy, v poradenských a expertizních firmách. Prioritním směrem je např. revitalizace narušených ekosystémů.
Biologie ochrany přírody - se zabývá problematikou biodiverzity a její ochrany se opírá o evoluční biologii, teoretickou a evoluční ekologii.
Absolventi naleznou své uplatnění ve vědeckých institucích, školách v oboru ekologie, hydrobiologie a ochrana životního prostředí. Podle zvolené specializace se dále uplatní se také v laboratořích zaměřených na analýzu životního prostředí, vodohospodářství, ochranu půdního fondu a obnovu ekosystémů. Aplikované specializace připravují absolventy pro práci v úřadech státní správy a samosprávy, v poradenských a expertizních firmách v neziskovém sektoru, které se zabývají problematikou životního prostředí.

Experimentální biologie

zahrnuje 4 specializace
Fyziologie rostlin - se soustřeďuje na mechanismy a ekofyziologii fotosyntézy, na buněčnou biologii a biotechnologii řas. 
Fyziologie živočichů - klade důraz na ekologickou a vývojovou fyziologii bezobratlých a vodních obratlovců ale i člověka. 
Genetika a genové inženýrství - je zaměřena především na přenos genů do rostlin, strukturu rostlinného genomu, genetiku rostlinných virů a viroidů. 
Buněčná a vývojová biologie - propojuje funkční a strukturální studium buněk rostlin a živočichů, zabývá se regulačními mechanismy v ontogenetickém vývoji v návaznosti na molekulární biologii.
Absolvent oboru se dle specializace může uplatnit ve vědeckých institucích, laboratořích a školách se zaměřením na funkční a strukturální studium buněk a v oboru regulačních mechanismů ontogenetického vývoje s návazností na molekulární biologii.  U zaměření na fyziologii rostlin či fyziologii živočichů se student uplatní ve vědeckých institucích, laboratořích a školách zabývajících se fyziologií rostlin či fyziologií živočichů.  U zaměření na genetiku lze uplatnění najít ve vědeckých institucích, školách a laboratořích včetně šlechtitelských laboratoří a firem zabývajících se genetikou a genovým inženýrstvím rostlin, živočichů, virů, molekulární genetikou, lidskou genetikou, cytogenetickou, genovým inženýrstvím, přenosem genů do rostlin a rostlinnými tkáňovými kulturami.

Klinická biologie

Poskytuje znalosti a dovednosti potřebné při provádění i náročných postupů v klinických laboratořích, pro interpretaci výsledků laboratorních nálezů a pro řízení kontroly kvality těchto laboratoří při rutinní diagnostice i ve výzkumu.
Absolvent oboru budou pracovat s vysoce náročnými laboratorními postupy a interpretovat laboratorní nálezy klinických laboratoří (specialisté, vedoucí laboratoří) při vyšetřování metabolických, krvetvorných, koagulačních, genetických a imunologických změn a toxikologických a parazitologických nálezů. Uplatní se také u firem pracujících pro zdravotnictví a ve výzkumných zdravotnických zařízení.

Parazitologie

Studuje parazity (prvoky i mnohobuněčné organismy) a parazitární infekce klasickými i moderními metodami z biochemických, molekulárně biologických a imunologických hledisek. Absolventi naleznou uplatnění mj. v diagnostických a klinických laboratořích v oblasti humánní i veterinární medicíny a v kontrolních laboratořích státní správy.
Absolvent oboru nalezne své uplatnění zejména ve vědeckých institucích, školách a laboratořích zabývajících se parazitologií, včetně diagnostických a klinických laboratoří v oblasti humánní i veterinární medicíny a kontrolních laboratoří státní správy.

Zoologie

zahrnuje 3 specializace
Zoologie obratlovců - se zabývá studiem populací, chování a bionomie obratlovců. 
Entomologie - je orientována především na morfologii, fyziologii a ekologii hmyzu. 
Ekologie živočichů - se věnuje studiu populací, chování a bionomie ostatních kmenů živočichů (“bezobratlí”).
Absolventi jednotlivých specializací oboru Zoologie naleznou své uplatnění ve vědeckých institucích a školách se zaměřením na studium živočichů a jejich populací, jejich chování a bionomie, orgánech ochrany přírody a státní správy, v zoologických zahradách, organizacích zabývajících se aplikovanou entomologií při ochraně rostlin před hmyzem.

Přehled kódů magisterských studijních programů a oborů je zde.

Tomáš Hauer, 18. 12. 2009
Osoba zodpovědná za obsah:
Prof. Václav Hypša