RNDr. Petr Nguyen, Ph.D.
vedoucí Laboratoře molekulární cytogenetiky
Přírodovědecká fakulta JU
Branišovská 31, 37005 České Budějovice
budova B, přízemí, číslo dveří 183
Email: petr.nguyen@prf.jcu.cz
Tel. +420 387 772 277
Životopis
ResearcherID: G-5826-2010
narozen: 17. března 1984 v Čáslavi
Vzdělání
2013 Ph.D. "cum laude" v oboru Molekulární a buněčná biologie a genetika, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (JU) a Biologické centrum AV ČR (BC)
2009 RNDr. v oboru Experimentální biologie, JU
2009 Mgr. v oboru Experimentální biologie, specializace Genetika a genové inženýrství, JU
2007 Bc. v oboru Biologie
Profesní zkušenosti
od 2019 vědecký asistent na Ústavu živočišné fyziologie a genetiky AV ČR.
od 2018 vědecký asistent na Entomologickém ústavu, BC.
2016-2017 University of Kansas, Lawrence, USA (c/o James R. Walters, 8 měsíců)
od r. 2014 odborný asistent na Přírodovědecké fakultě JU
od r. 2013 postdoktorand na Entomologickém ústavu, BC
2012 University of Liverpool, Liverpool, UK (c/o Ilik Saccheri, 3 měsíce)
2012 University of Buenos Aires, Buenos Aires, Argentina (c/o María José Bressa, 1 měsíc)
2010 Hokkaido University, Sapporo, Japonsko (c/o Ken Sahara, 1 měsíc)
2008 Hokkaido University, Sapporo, Japonsko (c/o Ken Sahara, 3 měsíce)
Vědecké projekty (hlavní řešitel)
2017-2019 GAČR reg. č. 17-17211S: Chromozomální přestavby v evoluci motýlů (Lepidoptera)
2016-2017 Fulbrightovo stipendium (grant č. 2016-21-06): Role inverzí a pohlavních chromozomů ve speciaci předivek rodu Yponomeuta
2014-2016 GAČR reg. č. 14-35819P: Role neo-pohlavních chromozomů v adaptivní radiaci bazálních motýlů skupiny Ditrysia
Články v impaktovaných časopisech
[ 379 citations, h-index 10 (Scopus; 2. dubna 2019)]
Carabajal Paladino LZ, Provazníková I, Berger M, Bass C, Aratchige NS, López SN, Marec F, Nguyen P (2019) Sex chromosome turnover in moths of the diverse superfamily Gelechioidea. Genome Biol Evol 11: 1307-1319
Štundlová J, Šmíd J, Nguyen P, Šťáhlavský F (2019) Cryptic diversity and dynamic chromosome evolution in Alpine scorpions (Euscorpiidae: Euscorpius). Mol Phyl Evol 134: 152-163
Dalíková M, Zrzavá M, Hladová I, Nguyen P, Šonský I, Flegrová M, Kubíčková S, Voleníková A, Kawahara AY, Peters RS, Marec F (2017) New insight into the evolution of W chromosome in Lepidoptera. J Hered 108: 709-719
Mongue AJ, Nguyen P, Voleníková A, Walters JR (2017) A neo-sex chromosome in the Monarch butterfly, Danaus plexippus. G3 (Bethesda) 7: 3281-3294
Sauer AJ, Fritsch E, Undorf-Spahn K, Nguyen P, Marec F, Heckel DG, Jehle JA (2017) Novel resistance to Cydia pomonella granulovirus (CpGV) in codling moth shows autosomal and dominant inheritance and confers cross-resistance to different CpGV genome groups. PLoS One 12: e0179157
Nováková E, Hypša V, Nguyen P, Husník F, Darby AC (2016) Genome sequence of Candidatus Arsenophonus lipopteni, the exclusive symbiont of a blood sucking fly Lipoptena cervi (Diptera: Hippoboscidae). Stand Genomic Sci 11: 72
Svojanovská H, Nguyen P, Hiřman M, Tuf IH, Wahab RA, Haddad CR, Šťáhlavský F (2016) Karyotype evolution in harvestmen of the suborder Cyphophthalmi (Opiliones). Cytogenet Genome Res 148: 227-236
Bombarová M, Špakulová M, Kello M, Nguyen P, Bazsalovicsová E, Kráľová-Hromadová I (2015) Cytogenetics of Aspidogaster limacoides (Trematoda, Aspidogastrea): karyotype, spermatocyte division and genome size. Parasitol Res 114: 1473-1483
Sadílek D*, Nguyen P*, Koç H, Kovařík F, Yağmur EA, Štáhlavský F (2015) Molecular cytogenetics of the Androctonus scorpions: Oasis of calm in turbulent karyotype evolution of the diverse family Buthidae. Biol J Lin Soc 115: 69-76
Šíchová J, Voleníková A, Dincă V, Nguyen P, Vila R, Sahara K, Marec F (2015) Dynamic karyotype evolutionand unique sex determination systems in Leptidea wood white butterflies. BMC Evol Biol 15: 89
Carabajal Paladino LZ*, Nguyen P*, Šíchová J, Marec F (2014) Mapping of single-copy genes by TSA-FISH in the codling moth, Cydia pomonella. BMC Genetics 15(Suppl 2):S15
Šíchová J, Nguyen P, Dalíková M, Marec F (2013) Chromosomal evolution in tortricid moths: conserved karyotypes with diverged features. PLoS One 8: e64520
Forman M, Nguyen P, Hula V, Král J (2013) Sex chromosome pairing and extensive NOR polymorphism in Wadicosa fidelis (Araneae: Lycosidae). Cytogenet Genome Res 141: 43-49
Nguyen P, Sýkorová M, Šíchová J, Kůta V, Dalíková M, Čapková-Frydrychová R, Neven LG, Sahara K, Marec F (2013) Neo-sex chromosomes and adaptive potential in tortricid pests. Proc Natl Acad Sci U S A 110: 6931-6936
Van’t Hof AE, Nguyen P, Dalíková M, Edmonds N, Marec F, Saccheri IJ (2013) A linkage map of the peppered moth (Biston betularia, Geometridae): a model of industrial melanism. Heredity 110: 283-295
Nguyen P, Sahara K, Yoshido A, Marec F (2010) Evolutionary dynamics of rDNA clusters on chromosomes of moths and butterflies (Lepidoptera). Genetica 138: 343–354
Bombarová M, Marec F, Nguyen P, Špakulová M (2007) Divergent location of ribosomal genes in chromosomes of fish thorny-headed worms, Pomphorhynchus laevis and P. tereticollis (Acanthocephala). Genetica 131: 141–149
Fuková I, Traut W, Vítková M, Nguyen P, Kubíčková S, Marec F (2007) Probing the W chromosome of the codling moth, Cydia pomonella, with sequences from microdissected sex chromatin. Chromosoma 116: 135-145
Fuková I, Nguyen P, Marec F (2005) Codling moth cytogenetics: karyotype, chromosomal location of rDNA, and molecular differentiation of sex chromosomes. Genome 48: 1083–1092
* autoři přispěli rovným dílem
Kapitoly v odborných knihách
Nguyen P, Carabajal Paladino LZ (2016) On the neo-sex chromosomes of Lepidoptera. In: Pontarotti P (Ed) Evolutionary Biology: Convergent Evolution, Evolution of Complex Traits, Concepts and Methods. Springer, Heidelberg. doi: 10.1007/978-3-319-41324-2
Konferenční příspěvky (výběr)
Nguyen P, Kreklová M, Hladová I, Petřvalská K, Vila R, Talavera G (2018) Sex chromosome evolution in lycaenid butterflies (Lycaenidae). The 10th International Workshop on Molecular Biology and Genetics of the Lepidoptera, 19. – 25. srpna, Kolympari, Kréta, Řecko, p. 61. (oral presentation)
Nguyen P (2018) Genome instability in blue butterflies (Lycaenidae). 8th International Conference on the Biology of Butterflies, 11. – 14. června, Bangalore, Indie, p. 41–42. (přednáška)
Nguyen P (2017) Cytogenetics of lepidopteran pests of the superfamilies Tortricoidea and Gelechioidea. The Third International Congress on Biological Invasions, 19. - 23. listopadu, Hangzhou, Čína, p. 87 (přednáška)
Nguyen P, Marec F (2017) Sex chromosome analysis in codling moth for better SIT. International Symposium for New Technology in Arthropod, 16. - 18. listopadu, Chongqing, Čína, p. 53 (přednáška)
Nguyen P (2017) Neo-sex chromosomes in Lepidoptera: Rule or exception? Butterflies as Genomic Models in Ecology and Evolution, 27. - 28. července, Penryn, Anglie (přednáška)
Nguyen P (2016) Turnover of sex chromosomes in Lepidoptera. Evolutionary Genomics of Sex, 17. - 19. listopadu, Tempe, Arizona, USA (přednáška)
Nguyen P, Carabajal Paladino LZ, Hladova I, Marec F (2015) Neo-sex chromosomes and their role in radiation of Lepidoptera. In: 19th Evolutionary Biology Meeting at Marseilles, 15. - 18. září, Marseilles, Francie, p. 29 (přednáška)
Nguyen P, Carabajal Paladino LZ, Marec F (2014) Parallel neo-sex chromosome evolution and radiations of lower ditrysian moths. In: Program and Abstracts, The 9th International Workshop on the Molecular Biology and Genetics of the Lepidoptera, 17. -23. srpna, Orthodox Academy of Crete, Kolympari, Kréta, Řecko, p. 11 (přednáška)
Nguyen P, Carabajal Paladino LZ, Sýkorová M, Marec F (2013) Neo-sex chromosomes as a key innovation in radiation of lower ditrysian moths. In: Programme and Abstracts, Advances in Ecological Speciation, 29. - 30. dubna, CIBIO/UP Vairao, Portugalsko, p. 23 (přednáška)
Zvané přednášky
Nguyen P (2017) Evolution of sex chromosomes in Lepidoptera. College of Plant Protection, Northwest A&F University, Yangling, Čína
Nguyen P (2015) Role of neo-sex chromosomes in ecological adaptation and radiation of lower Lepidoptera. Institute for Biological Control, Julius Kühn Institute, Darmstadt, Německo
Nguyen P (2015) Codling moth sex chromosomes in relation to pest management. International Codling Moth Genome Sequencing Symposium, 18.-19. listopadu, Institute of Plant Protection of the Chinese Academy of Agricultural Sciences, Peking, Čína
Relevantní školení a kurzy
5 th Workshop on the Application of Next Generation Sequencing to Repetitive DNA Analysis in Plants, 24. - 26. května 2016, České Budějovice, Česká republika
Workshop on Population and Speciation Genomics, 24. ledna – 6. února 2016, Český Krumlov, Česká republika
Workshop on Advances in Bioinformatics and Genomics, 24. - 30. září 2012, České Budějovice, Česká republika
Výuka a vedení kvalifikačních prací
od r. 2015 KMB/221 Evoluční genetika živočichů, Přírodovědecká fakulta JU
2014-2015 KGN/244 Základy genového inženýrství, Přírodovědecká fakulta JU
od r. 2012 3 bakalářské a 4 diplomové práce obhájené, 2 diplomové a 1 dizertační práce běžící