• Home
  • PŘF - Přírodovědecká fakulta JU

Informace pro uchazeče o bakalářské studium

Vážení uchazeči,

informace o výsledku Vašich přijímacích zkoušek naleznete v prostředí e-přihlášky na https://wstag.jcu.cz/portal/studium/uchazec/eprihlaska.html.
Všichni uchazeči obdrží ještě dopis s výsledkem řízení.

Uchazeči, kteří nedoručili maturitní vysvědčení a současně požádali o odložení této povinnosti budou o výsledku zkoušky informováni pouze elektronickou poštou s tím, že v případě splnění zkoušky budou formálně přijati až po doručení dokladu o ukončeném středoškolském vzdělání.

Studijní oddělení

Inhibice mevalonátové dráhy pomocí cíleného podání atorvastatinu imunitním buňkám zabraňuje jejich prozánětlivému fenotypu

Aby prozánětlivé imunitní buňky efektivně plnily svou baktericidní roli, je nezbytné, aby vhodně upravily své metabolické nastavení. Pokud je však tato úprava buněčného metabolismu vyvolána chronicky, přispívá k rozvoji mnoha lidských onemocnění, jako je například metabolický syndrom, diabetes nebo ateroskleróza. Z toho důvodu je ovlivnění metabolické polarizace makrofágu vnímáno jako účinná strategie léčby těchto onemocnění. Ačkoli bylo v předchozích studiích identifikováno mnoho nízkomolekulárních inhibitorů ovlivňujících metabolismus imunitních buněk, jejich podání vyžaduje nástroj pro doručení těchto metabolických inhibitorů specificky makrofágům, aby se omezily jejich potenciální vedlejší účinky na další tkáně.

V této práci zavedla skupina Adama Bajgara ve spolupráci s VŠCHT v Praze octomilku Drosophila melanogasterjako jednoduchý experimentální model pro in vivo testování nástrojů pro specifické podávání nízkomolekulárních metabolických inhibitorů makrofágům. V rámci této studie bylo dále zjištěno, že glukanové částice připravené z kvasinek jsou vhodné pro makrofágově specifickou administraci atorvastatinu. Atorvastatin je inhibitor hydroxy-methyl-glutaryl-CoA reduktázy (Hmgcr), což je klíčový enzym mevalonátové dráhy. Pomocí tohoto nástroje dále prokázali, že mevalonátová dráha je nezbytná pro prozánětlivou polarizaci makrofágů, jejich úspěšný boj s bakteriální infekcí a tedy i pro přežití infikovaného jedince.

Krejčová, G.Ruphuy, G.Šalamúnová, P.Sonntag, E.Štěpánek, F. & Bajgar, A. (2024Inhibition of mevalonate pathway by macrophage-specific delivery of atorvastatin prevents their pro-inflammatory polarisation. Insect Molecular Biology, 115. Available from: https://doi.org/10.1111/imb.12900

 

Kontakt: Mgr. Adam Bajgar, Ph.D. (bajgaa00 at prf.jcu.cz)

 

 

 

Obrázky:

1) Glukanové částice s atorvastatinem připravené metodou "spray drying" jsou specificky rozpoznávány a pohlceny imunitními buňkami octomilek. V těchto buňkách se pak atorvastatin uvolňuje z částic a inhibuje aktivitu klíčového enzymu mevalonátové dráhy, což následně vyústí ve zhoršenou schopnost imunitních buněk bojovat s bakteriální infekcí.

2) Fotografie z transmisního elektronového mikroskopu zachycující imunitní buňku octomilky (zeleně) obsahující glukanové částice s atorvastatinem (modře). Kredit: Gabriela Krejčová, Adam Bajgar 

 

 

Inhibition of mevalonate pathway by macrophage-specific delivery of atorvastatin prevents their pro-inflammatory polarisation

Adjustment of the cellular metabolism of pro-inflammatory macrophages is essential for their bactericidal function; however, if induced chronically, it underlies the development of many human diseases such as atherosclerosis, metabolic syndrome or diabetes. Therefore, intervention of macrophage metabolic polarisation has been recognised as a potent strategy for their treatment. Although many small-molecule inhibitors affecting macrophage metabolism have been identified, their in vivo administration requires a tool for macrophage-specific delivery to limit their potential side effects.


In this study, the research group led by Dr. Adam Bajgar established Drosophila melanogaster as a simple experimental model for in vivo testing of macrophage-specific delivery of small-molecule inhibitors. The authors showed that yeast-derived glucan particles (GPs) are suitable for macrophage-specific delivery of atorvastatin. Atorvastatin is an inhibitor of hydroxy-methyl-glutaryl-CoA reductase (Hmgcr), a key enzyme of the mevalonate pathway. Systemic administration of GPs loaded with atorvastatin leads to intervention of mevalonate pathway specifically in macrophages, without affecting HMGCR activity in other tissues. Using this tool, they further demonstrated that the mevalonate pathway is essential for the pro-inflammatory polarization of macrophages, their successful fight against bacterial infection, and thus for the survival of the infected individual.

Krejčová, G.Ruphuy, G.Šalamúnová, P.Sonntag, E.Štěpánek, F. & Bajgar, A. (2024Inhibition of mevalonate pathway by macrophage-specific delivery of atorvastatin prevents their pro-inflammatory polarisation. Insect Molecular Biology, 115. Available from: https://doi.org/10.1111/imb.12900

Contact: Mgr. Adam Bajgar, Ph.D. (bajgaa00 at prf.jcu.cz)

 

 

Pictures:

1) Glucan particles with atorvastatin prepared by the "spray drying" method are specifically recognized and engulfed by immune cells of octopi. In these cells, atorvastatin is then released from the particles and inhibits the activity of a key enzyme of the mevalonate pathway, which subsequently results in an impaired ability of the immune cells to fight the bacterial infection.

2) Transmission electron microscope image showing an octopus immune cell (green) containing glucan particles with atorvastatin (blue). Credit: Gabriela Krejčová, Adam Bajgar

Instructions for graduations held on 5 March 2024

Dear recent graduates,

You have successfully completed your Bachelor's, Master's or Doctoral studies at the Faculty of Science, for which I warmly congratulate you. Now you are going to graduate, which will take place on 5 March 2024 at DK Metropol on Senovážné náměstí.

We would like you and your loved ones to have fond memories of the graduation, so I hope that you will do your best to make the graduation smooth and dignified. To do this, among other things, you need to familiarize yourself with the ceremony script and rehearse some parts before the actual ceremony. Therefore, we ask that you arrive on time for the briefing, which begins at 9:45 am.

The graduation ceremony is set to begin at 10:30 am.
Please let the guests you invite to the graduation know that they will be able to take their seats in the auditorium approximately 20 minutes before the ceremony begins (i.e., 10:10 a.m.). There should be plenty of seating.

If any of you know for certain that you will not be attending the graduation ceremony, please let the Office of Student Services know.

Congratulations again on your successful completion of your studies and I look forward to seeing you on graduation day.

 


Tomas Hauer
Vice Dean for Studies

Translated with DeepL.com (free version)

Instrukce k promoci září 2021

Vážení čerství absolventi,

úspěšně jste zakončili bakalářské, magisterské či doktorské studium na Přírodovědecké fakultě, k čemuž Vám srdečně blahopřeji. Nyní Vás čeká ještě promoce. Promoce se budou konat 17. září 2021 v DK Slavie (velká žlutá budova na nábřeží Malše za Jihočeským divadlem).

 V příloze najdete rozdělení do skupin pro promoční obřad.

Moc bychom si přáli, aby Vám a Vašim blízkým zůstaly na promoci hezké vzpomínky, proto spoléhám, že i Vy se budete spolu s námi snažit, aby průběh promoce byl hladký a důstojný. K tomu je mimo jiné potřeba, abyste se před vlastním obřadem seznámili s jeho scénářem a vyzkoušeli si některé části. Proto Vás prosím, abyste se dostavili včas k instruktáži:

  • první skupina v 9:00 hodin,
  • druhá skupina v 11:30 hodin,
  • třetí skupina v 14:00 hodin.

Začátky promocí jsou v 9:45 hodin, 12:15 a ve 14:45 hodin.

Hostům, které si na promoci pozvete, sdělte, že cca 20 minut před zahájením obřadu (tedy od 9:25, 11:55 a od 14:25) budou moci zaujmout místa v sále. Míst k sezení by měl být dostatek.

Abychom minimalizovali riziko šíření onemocnění COVID-19, budou během celého dne platit následující opatření:

  • všechny osoby pohybující se mimo trvání promočního obřadu v objektu musí používat vhodnou ochranu dýchacích cest (respirátor třídy FFP2 nebo roušku srovnatelné kvality), osoby bez takové ochrany nebudou na akci vpuštěny;
  • povinnost mít během obřadu nasazenou ochrany dýchacích cest neplatí pro promoční kolegium a promované absolventy.

Pokud někdo z Vás ví určitě, že se promočního obřadu nezúčastní, prosím, aby to sdělil na studijní oddělení.

Ještě jednou blahopřeji k úspěšnému zakončení studia a těším se na shledanou s Vámi v den promoce.

Instrukce k promocím konaným 5. března 2024

Vážení čerství absolventi,

úspěšně jste zakončili bakalářské, magisterské či doktorské studium na Přírodovědecké fakultě, k čemuž Vám srdečně blahopřeji. Nyní Vás čeká ještě promoce, která se bude konat 5. března 2024 v DK Metropol na Senovážném náměstí.

Moc bychom si přáli, aby Vám a Vašim blízkým zůstaly na promoci hezké vzpomínky, proto spoléhám, že i Vy se budete spolu s námi snažit, aby průběh promoce byl hladký a důstojný. K tomu je mimo jiné potřeba, abyste se před vlastním obřadem seznámili s jeho scénářem a vyzkoušeli si některé části. Proto Vás prosím, abyste se dostavili včas k instruktáži, která začíná v 9:45 hodin.

Začátek promočního obřadu je stanoven na 10:30 hodin.
Hostům, které si na promoci pozvete, sdělte, že cca 20 minut před zahájením obřadu (tedy od 10:10) budou moci zaujmout místa v sále. Míst k sezení by měl být dostatek.

Pokud někdo z Vás ví určitě, že se promočního obřadu nezúčastní, prosím, aby to sdělil na studijní oddělení.

Ještě jednou blahopřeji k úspěšnému zakončení studia a těším se na shledanou s Vámi v den promoce.

 


Tomáš Hauer
proděkan pro studium

Invitation to a discussin with Dr. Schneider: Ethics in Science

We cordially invite you to a discussion with a leading expert in scientific ethics, Dr. Leonid Schneider. He is a person who has devoted his efforts to exposing various plagiarized, problematic and falsified scientific articles on his blog https://forbetterscience.com/, and has also addressed, among other things, well-known Czech cases, or Dr. Sabatini, who has been newly recruited at the UOCHBCH.

We recommend participation especially to students, postdocs, and in view of the aforementioned ethics problems that occur in our country as well. This opportunity will allow you to actively participate in the debate and share your thoughts on ethics in science and help you prepare for your future career in science, medicine and other fields.   

 Date and time: 11 December 2023 9:30

 Location: room C1 (building C)

 For more information about Dr. Leonid Schneider and his work, visit his blog For Better Science.

 

invitation-schneider-student-discussion

Jak farmaka a oteplování ovlivňují sladkovodní ekosystémy aneb vážky v teple a na práškách

Jak farmaka a oteplování ovlivňují sladkovodní ekosystémy aneb vážky v teple a na práškách

Člověk svými aktivitami mění krajinu a životní prostředí včetně sladkovodních ekosystémů. Kromě přímého působení, zahrnujícího vysoušení mokřadů, narovnávání toků, výstavbu vodních děl a používání vody pro spotřebu vlastní či v zemědělství, se jedná i o řadu nepřímých vlivů, kterým se organismy buď přizpůsobí, nebo zahynou. Spolu s probíhající globální změnou klimatu k nim patří také úniky průmyslově vyráběných látek do povrchových vod. Velkou neznámou v působení těchto stresorů na sladkovodní ekosystémy je to, jak se jejich vlivy kombinují. Vlivy různých stresorů se mohou navzájem sčítat, násobit nebo naopak vyrušit. První studii o dopadech kombinace léků a oteplení na společenstva sladkovodních bezobratlých jsme publikovali nyní v mezinárodním časopise Water Research ve spolupráci s vědci z Fakulty rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a o výsledcích se můžete také dočíst v článku na serveru Ekolist.cz

 
Obrázek: Vrcholovými predátory v nádržích byly larvy vážek rodů Anax (na snímku) a Aeshna, Vojtěch Kolář

Jak působí soli na virovou proteázu HRV 3C?

Fyzikálně chemické vlastnosti proteinů jsou nevyhnutelně ovlivňovány roztokem, v němž se nacházejí. Tento roztok působí na jejich stabilitu, dynamiku struktury proteinů a také na jejich aktivitu. Mezi jednoduché a zároveň intenzivně studované mechanismy náleží Hofmeisterův jev, který souvisí s působením různých anorganických solí na iontovou sílu roztoku. Je známo, že složení solí v roztoku ovlivňuje řadu biofyzikálních a biochemických procesů, včetně stability proteinů a jejich enzymatické aktivity. Výzkum těchto procesů má uplatnění v řadě odvětví, včetně astrobiologie, protože roztoky solí představují podstatný prvek prostředí na řady jiných světů Sluneční soustavy, počínaje Marsem.

 Babak Minofar z Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a jeho spolupracovníci ve své nové studii systematicky analyzovali vliv roztoků vybraných solí na proteázu HRV 3C, která pochází z lidského rhinoviru-14 ze skupiny pikornanivů, jednoho z původců rýmy. Tuto konkrétní proteázu, která je zodpovědná za zpracování polyproteinu zmíněného viru si zvolili především kvůli tomu, že je perspektivní pro využití v rekombinantních proteinech pro farmaceutické a biochemické aplikace.

 Badatelé ve výzkumu použili pět aniontů sodných solí – sulfát, fosfát, chlorid, bromid a perchlorát a zkoumali jejich vliv na katalytické a konformační vlastnosti proteázy HRV 3C. Vlastnosti proteázy přitom sledovali pomocí spektra cirkulárního dichroismu, tyrosinové fluorescence, diferenční skenovací kalorimetrie a simulací molekulární dynamiky. Výsledky výzkumu ukázaly, že anionty mají významný vliv na vlastnosti studovaného proteinu, v souladu s Hofmeisterovým jevem. Korelace stabilizujícího vlivu aniontů na protein s hustotou elektrického náboje aniontu přitom naznačují, že dochází k přímé interakci mezi anionty a proteázou HRV 3C.

 

Dušeková, E., Berta, M., Sedláková, D., Řeha, D., Dzurillová, V., Shaposhnikova, A., Fadaei, F., Tomková, M., Minofar, B., Sedlák, E. 2022. Specific anion effect on properties of HRV 3C protease. Biophysical Chemistry 287: 106825.

Kontakt: Babak Minofar (minofar at nh.cas.cz)

 

Obrázek: Vliv soli na proteázu. Kredit: Dušeková et al. (2022).

Jak souvisí osobnost kosmanů bělovousých s jejich reprodukčním úspěchem?

Individuální rozdíly v chování neboli osobnost jsou v současné době popsány u řady druhů živočichů od octomilek po šimpanze. Pod pojmem osobnost si lze představit, že někteří jedinci jsou například agresivnější nebo zvědavější než jiní, což jim za určitých okolností přináší výhody (např. zvědavější jedinci rychleji najdou potravu) a jindy to pro ně může být naopak nevýhodné (např. zvědavější neutečou včas v nebezpečné situaci). Mechanismy, které udržují v populacích živočichů různé typy osobností, ale stále zůstávají nejasné. A právě vztah mezi osobností a reprodukčním úspěchem či biologickou zdatností by mohl být jedním z takových mechanismů. Tento vztah je ale překvapivě málo prozkoumán u primátů, kteří přitom nabízejí rozličné sociální a reprodukční strategie.

Michaela Másílková, Martina Konečná a David Boukal z Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a jejich kolegové v rámci svého výzkumu detailně prozkoumali vztahy mezi vybranými znaky osobnosti rodičů a jejich reprodukčním úspěchem u kosmanů bělovousých (Callithrix jacchus), kteří jsou oblíbeným modelovým druhem v biomedicínském výzkumu. Jde o první podobnou studii u primáta s kooperativní péčí o mláďata, tj. s podobnou strategií jaká se nachází u lidí. U kosmanů, pro které jsou typické porody dvojčat, se rozmnožuje jediný reprodukční pár, o jehož mláďata se stará celá skupina, včetně otce.

Badatelé sledovali rodiče obou pohlaví, přičemž se soustředili na pětici vybraných osobnostních znaků: Přívětivost, Asertivita, Svědomitost, Zvídavost a Trpělivost. Původně předpokládali, že páry, v nichž budou mít samice a samec podobnější osobnost, budou úspěšnější při rozmnožování. Takový vztah je známý od jiných druhů živočichů s dlouhodobými svazky a se zapojením rodičů do péče o potomky. U kosmanů bělovousých se to ale nepotvrdilo. Ukázalo se, že osobnost samic, zejména jejich Přívětivost a Zvídavost, podstatně ovlivňuje intervaly mezi porody a míru plodnosti. Naopak osobnost samců kosmanů měla na úspěšnost rozmnožování daného páru jen omezený vliv, což může být dáno i přítomností ostatních členů skupiny, kteří se starají o mláďata. Autoři studie dospěli k závěru, že různé aspekty osobnosti kosmanů do jisté míry ovlivňují jejich rozmnožování. Jejich výzkum přináší nové pohledy na mechanismy, které udržují různé typy osobností v populacích druhů s kooperativní péčí o mláďata.

Másílková, M., Boukal, D., Ash, H., Buchanan-Smith, H. M., Konečná, M. 2022. Linking personality traits and reproductive success in common marmoset (Callithrix jacchus). Scientific Reports 12: 13341.

Kontakt: Mgr. Michaela Másílková, Ph.D. (michaela.masilkova at gmail.com)

Obrázek: Kosman bělovousý, autor: Tereza Šindelářová

Jak založit květnatý trávník

Galerie:
  • images/PRF/Marketing/travniky/dscn6836.jpg, Autor: Jiří Řehounek
  • images/PRF/Marketing/travniky/dscn6838.jpg, Autor: Jiří Řehounek
  • images/PRF/Marketing/travniky/dscn6843.jpg, Autor: Jiří Řehounek
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_134149.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_134210.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_134441.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_134456.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_134633.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_141015.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_141025.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_141221-edit.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_141322.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_141459.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_141610-edit.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_142215.jpg, Autor: PřF JU
  • images/PRF/Marketing/travniky/img_20230904_142748.jpg, Autor: PřF JU

Calla – Sdružení pro záchranu prostředí & Přírodovědecká fakulta JU pořádaly dne 4.9.2023 odborný seminář "Jak založit květnatý trávník".

Hlavním cílem semináře bylo seznámit odbornou veřejnost s možnostmi zakládání květnatých trávníků a získávání vhodného osiva pro tyto účely. Součástí semináře byla praktická ukázka stroje na kartáčování osiva.
Seminář byl určen především zástupcům státní správy a samosprávy, nevládních organizací a firem a také dalším zájemcům o tuto problematiku.

 

Seminář je součástí projektu s názvem „Regionální směsi osiv jako účinný nástroj ochrany diverzity lučních biotopů“. Projekt realizuje Český svaz ochránců přírody společně s partnery: Pracovní skupina ekologie obnovy, PřF JU, Ústav botaniky a zoologie, Agrostis Trávníky, ZO ČSOP Bílé Karpaty, Český svaz ochránců přírody Vlašim, Høgskulen på Vestlandet HVL a BROZ (Bratislavské regionálne ochranárske združenie). Podpořeno Norskem prostřednictvím Norských fondů.

Jarní promoce

Jarní promoce absolventů všech stupňů studia se posouvá na 8. dubna 2022.

Jaromír Beneš na římské univerzitě La Sapienza

Ve dnech 20.-23. 11. bude mít vedoucí Laboratoře archeobotaniky a paleoekologie Přírodovědecké fakulty JU Jaromír Beneš na římské univerzitě La Sapienza cyklus přednášek na téma Počátky zemědělství a krajinné transformace.
Cyklus proběhne v rámci mezinárodního magisterského studia Science and Technology for the Conservation of Cultural Heritage.
Tématem čtyř přednášek jsou vedle pohledu na nejstarší světová vzniku zemědělství na Předním Východě, Číně, Mexiku a v Africe I klíčové tranformace krajiny v Evropě od neolitu do vrcholného středověku.

Jednoduché a dostupné pokusy z optiky - workshop nejen pro učitele fyziky

Vážení středoškolští učitelé,

zveme Vás na jednodenní workshop, na kterém si nejprve ukážeme několik zajímavých fyzikálních pokusů za pomoci laserového ukazovátka – měření difúzního koeficientu, měření tloušťky lidského vlasu, sestavení jednoduchého mikroskopu, nebo ukázky Aragova-Poissonova-Fresnelova bodu tak trochu jinak. Na konci se přesuneme ke sluneční fyzice – ukážeme si experimenty, které by mohly podnítit ke studiu fyziky i žáky se spíše uměleckým zaměřením.

Všechny pokusy budou snadno zopakovatelné v prostřední středních škol a účastníci je tak budou moci jednoduše zařadit do své výuky.

Kurz je pro pedagogy zdarma.

Přihlášky na This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

Kurz probíhá na PřF JU, 20. října od 8:30 do cca 14:00.

Jemný úvod do maticového a vektorového počtu - nová publikace

Nová publikace vydaná za podpory Centra pro přírodovědné vzdělávání: 

Jemný úvod do maticového a vektorového počtu

Autor: Jan Eisner, Lenka Zalabová

Studijní text je určen pro první seznámení s vektory, maticemi a elementární lineární algebrou.

Publikace dostupná zde.

 

Jihočeští vědci objevili nové kmeny bakterií, kterými se zabývá celý svět

Bakterie jsou na Zemi všudypřítomné a výrazně ovlivňují život všech živočichů, včetně člověka. Zároveň jsou schopné někdy až neuvěřitelné adaptace na okolní prostředí a svého hostitele. Z tohoto důvodu je výzkum evoluce bakterií velmi důležitý pro pochopení toho, jaký účinek mohou mít bakterie na hostitelský organismus a jak se proti nim eventuálně bránit či je naopak lépe využít v léčbě. Vědcům z Přírodovědecké fakulty JU se nyní podařilo dosáhnout ve výzkumu evoluce bakterií významného objevu. Důkazem je fakt, že objev zveřejnil prestižní vědecký časopis Microbiome.

Práce vědců PřF JU se týká wolbachií, velmi hojných bakterií, které se často vyskytují v mikrobiomech bezobratlých živočichů a projevují se širokým spektrem životních stylů od parazitismu po mutualismus, tedy oboustranně výhodnou symbiózu.

Schopnosti wolbachií ovlivňovat organismus hostitele jsou přitom natolik fascinující, že se těmi bakteriemi zabývají v širokém měřítku vědecká pracoviště na celém světě.

Některé druhy wolbachií například dokáží ovlivnit rozmnožování svých hostitelů. A to tak, že samečci určitých druhů hmyzu, nakažení wolbachiemi, mohou mít potomstvo pouze se stejně nakaženými samičkami. A tyto bakterie umí i jinými způsoby manipulovat s reprodukčním potenciálem hostitele.

Některé wolbachie mají ale pro hostitelský organismus zásadně pozitivní význam, jsou to „mutualisté“, bez nichž se hostitel ve svém životě neobejde.

Vědci z Přírodovědecké fakulty JU se ve svém výzkumu zabývali skupinou wolbachií, označovanou písmenem F a mezi biology považovanou za biologicky obzvlášť zajímavou. A ačkoliv je tedy tato skupina už dlouho v hledáčku různých vědeckých pracovišť, podařilo se jihočeským vědcům objevit v této skupině pomocí sekvencí DNA a fluorescenčního zobrazení 5 dosud neobjevených kmenů wolbachií. A to v mikrobiomu čtyř druhů všenek. Pozoruhodný je však především fakt, že genomy těchto nově objevených wolbachií dosáhly různých evolučních stádií a představují dva pozoruhodně odlišné typy genomu symbionta.

Zatímco první tři z těchto genomů se podobají jiným známým členům skupiny F, další dva jsou zřejmě v evoluční přeměně dále a vykazují známky pokročilé deaktivace a odstraňování genů.

„Aby se v průběhu evoluce mohla stát wolbachie pro hostitelský organismus prospěšným symbiontem, postupně ztrácela některé geny, které se v tomto procesu ukázaly jako nepotřebné, případně by hostiteli mohly škodit. Genom se tak postupně zmenšoval,“ řekl portálu ScienceZoom vedoucí výzkumného týmu Václav Hypša.

Příkladem takového „evolučního zmenšování“ genomu byl zejména symbiont „wMeur1“, jeden z pěti nově objevených kmenů wolbachií, detekovaných jihočeskými vědci ve všenkách. „Genom kmene wMeur1 z mikrobiomu všenek představuje v současnosti nejmenší známý genom wolbachie a první příklad wolbachií, které dokončily proces zmenšení svého genomu směrem k co nejefektivnější symbióze s hostitelem,“ řekl Hypša.

O tom, že se tento konkrétní kmen wolbachie skupiny F postupně přizpůsoboval soužití s hostitelským organismem, svědčí mimo jiné fakt, že „wMeur1“ převzal od jiných bakterií z vnějšku geny, schopné produkovat pro všenky životně důležitý vitamín. „To poukazuje na to, že navzdory velkému množství a velké rozmanitosti známých kmenů wolbachie zůstává evoluční potenciál wolbachií nedostatečně prozkoumaný,“ píší autoři v závěru své zprávy.

Objev jihočeských vědců otevírá cestu k dalšímu výzkumu těchto bakterií, které jsou pro své evoluční schopnosti předmětem vědeckého zkoumání na celém světě. Poznání toho, jak tyto bakterie přesně fungují a přizpůsobují se organismům svých hostitelů nebo ho samy ovlivňují, totiž může vést například i pokroku v medicíně či biologii. V případě objevu týmu PřF JU je navíc důležité, že pět různých, nově objevených kmenů wolbachií skupiny F, se nachází v různých evolučních stádiích a je tedy je možné mezi sebou porovnávat a dokumentovat směr evolučního procesu. Význam práce jihočeských vědců podtrhuje právě fakt, že jejich studii zveřejnil prestižní časopis Microbiome.

bakterie_clanek

Autor textu: Marek Kerles

Jihočeští vědci se podíleli na významném objevu

Spolupráce vědců z Michigan State University, University of California Berkeley, Lawrence Berkeley National Laboratory, Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a Biologického centra AV ČR vedla k významnému objevu v oblasti fotosyntézy.

Studie, na níž se podíleli také Tomáš Polívka a David Bína z Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a Biologického centra AV ČR, byla 31. srpna publikována v nejprestižnějším vědeckém časopise Nature.

Fotosyntéza je klíčový proces pro udržení života na planetě, jelikož je jako jediný schopen zpracovávat sluneční energii a převádět ji na jiné formy energie, které živé organismy včetně člověka mohou využívat. Jelikož veškerá potrava je fotosyntetického původu, ať už jako primární produkt (ovoce, zelenina, obilí, …) nebo jako produkt sekundární (maso, mléko, …), je detailní pochopení fotosyntetických procesů zásadní nejen pro základní výzkum, ale i pro zvládnutí společenských výzev jako například zajištění dostatku potravin pro stále se zvyšující populaci na planetě.

Fotosyntézu máme dnes spojenou především se zelenými rostlinami, ale využívat sluneční záření pomocí fotosyntézy umí i jednodušší organismy, jako jsou například sinice. A právě na tyto jednodušší organismy cílí publikovaná studie. Všechny fotosyntetické organismy mají speciální útvary složené z proteinů, jejichž jediným úkolem je zachytit sluneční záření a získanou energii odevzdat dalším proteinům, které ji přemění na chemickou energii. Tyto útvary, které se nazývají světlosběrné antény, jsou u sinic velmi specifické, a jejich detailní struktura a mechanismus přenosu energie nebyly dosud známé.

Devítičlennému týmu složenému z odborníků na elektronovou mikroskopii, strukturní biologii, molekulární biologii a biofyziku se nyní podařilo tyto antény sinic do detailu popsat a zobrazit. Navíc, detailní znalost struktury umožnila zjistit, jak se zachycená energie celým systémem přenáší. Tuto analýzu provedli právě jihočeští vědci. „Měli jsme štěstí, že jsme vytvořili tým odborníků z různých oborů, kteří se skvěle doplňovali. Celá skupina měla tu správnou chemii“ říká Cheryl Kerfeld, profesorka strukturního bioinženýrství na Michigan State University, která celý projekt vedla. „Výsledkem je jedenáct stran objevů a překvapení“ doplňuje Maria Agustina Domínguez-Martín, první autorka publikace. Prostor, který časopis Nature této studii dal, je mimořádný, jelikož většina publikací v tomto prestižním časopisu má rozsah zhruba poloviční. To jen podtrhuje význam práce mezinárodního týmu vědců.

Kromě pochopení struktury a funkce světlosběrných antén sinic totiž studie obsahuje ještě další významný objev. Všechny fotosyntetické organismy se potýkají s problémem, jak ochránit svůj fotosyntetický aparát, když je světla příliš mnoho. U sinic bylo již dlouhou dobu známo, že za regulaci toku energie odpovídá malý protein zvaný OCP (z anglického Orange Carotenoid Protein), ale dosud nebylo vůbec jasné, jak tento protein funguje. Mezinárodnímu týmu vědců se pomocí elektronové mikroskopie podařilo odhalit místa, kde se tento malý protein váže na anténu. To byl první zásadní krok k pochopení mechanismu, jak tento protein může ovlivnit tok energie v mnohonásobně větší světlosběrné anténě. Následné modelování přenosu energie, které bylo výsledkem práce jihočeských vědců, mechanismus akce tohoto proteinu spolehlivě vysvětlilo. Celý systém je optimalizován tak, že OCP protein odebere přebytečnou energii z antény a bezpečně ji převede na teplo. „Velmi si vážím možnosti pracovat v tomto skvělém týmu“ říká Tomáš Polívka, profesor biofyziky na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity, který s Cheryl Kerfeld spolupracuje již téměř dvacet let. „Vidět poprvé strukturu celého systému byl neskutečný zážitek. Hned bylo jasné, že je to zásadní průlom, který nám umožní do detailu pochopit, jak systém funguje“, doplňuje.

Pochopení struktury a mechanismu zachycování a regulace světelné energie v sinicích je průlomovým objevem zejména proto, že je to poprvé v historii fotosyntetického výzkumu, kdy je možné „vidět“ jak nějaký fotosyntetický organismus omezuje svůj výkon v případě nadměrného množství světla. Studie je výchozím bodem pro další výzkum, včetně možných aplikací v oblasti umělé fotosyntézy, biotechnologií využívajících sinic například pro získávání specifických látek nebo i omezení nežádoucího výskytu sinic na vodních plochách.

Odkaz na publikaci: Dominguez-Martin, M.A., Sauer, P.V., Kirst, H., Sutter, M., Bína, D., Greber, B.J., Nogales, E., Polívka, T., Kerfeld, C.A. Structures of a phycobilisome in light-harvesting and photoprotected states. Nature 2022.

https://www.nature.com/articles/s41586-022-05156-4 <

Kontakt: prof. Tomáš Polívka, Katedra fyziky, Přírodovědecká fakulta JU, Branišovská 1760, 37005 České Budějovice; tel. 777 729 590; e-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

nature

Umělecké ztvárnění světlosběrného aparátu sinic. Základní složky antény jsou znázorněny modře a zeleně, OCP protein je v oranžové barvě. © Janet Iwasa, University of Utah.

Jiřická nádrž v Novohradských horách dostane efektivnější ochranu, slíbil jihočeský hejtman vědcům

Schůzka jihočeského hejtmana Martina Kuby s vědci z Biologického centra Akademie věd ČR a Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, kteří v červnu předali na Jihočeský kraj výsledky petice za ochranu Jiřické nádrže v Novohradských horách s více než dvěma tisíci podpisy, přinesla ovoce. Odborníci se s vedením kraje shodli na tom, že tato rašelinná nádrž, pocházející z roku 1774, potřebuje efektivnější status ochrany. Jak hejtman sdělil, odbor životního prostředí kraje má v plánu zahájit práce na přípravu vyhlášení Jiřické nádrže formou samostatné zvláštní územní ochrany. Reálný předpoklad vyhlášení zvláště chráněného území je do tří let. S tím souvisí i nastavení nového způsobu hospodaření, odpovídající moderním požadavkům na péči o chráněná území. To je důležité nejen pro zachování přírodní rozmanitosti a vzácných druhů živočichů v srdci Novohradských hor, zachování krajinného rázu a prostupnosti a přístupnosti krajiny, ale také pro udržení vysoké kvality pitné vody pro Českobudějovicko, protože jde o území v povodí vodárenské nádrže Římov.

Velké obavy o osud této nádrže s charakterem přírodního horského jezera mají jihočeští hydrobiologové kvůli komerčním aktivitám soukromého vlastníka, který v Jiřické nádrži provozuje rekreační rybolov a vysazuje pro horský ekosystém zcela nevhodné, nepůvodní a nežádoucí druhy ryb. Následkem tohoto nepřiměřeného rybářského využití dochází k ničení přírodních hodnot této unikátní lokality, včetně pustošení vzácných živočichů, jako jsou obojživelníci či ohrožené střevle potoční. (Komerční rybolov devastuje ohrožené druhy v srdci Novohradských hor. Jihočeští vědci volají po ochraně Jiřické nádrže)

Ve své petici adresované zastupitelům a hejtmanovi Jihočeského kraje odborníci původně požadovali, aby byla Jiřická nádrž zahrnuta do území nově vyhlášené Přírodní památky Pohoří na Šumavě. K tomu však nedojde. „Vyjasnili jsme si, že z procesních důvodů je velmi problematické do této přírodní památky nyní nádrž zařadit. Nicméně mezi námi panuje jednoznačná shoda na tom, že Jiřická nádrž a její bezprostřední okolí má mít efektivnější statut ochrany a že se na tom bude pracovat,“ říká ředitel Biologického centra AV ČR Libor Grubhoffer. Lepší úroveň ochrany, ať se bude jednat o přírodní památku, území se statutem ochrany vod či jiné, by se měla vyhlásit do tří let. Ve hře také zůstává vyhlášení chráněné krajinné oblasti, zmínil jihočeský hejtman.

 

Hospodaření v Jiřické nádrži, ale i v dalších horských nádržích v Novohradských horách má zásadní vliv na kvalitu pitné vody z nádrže Římov

Kromě toho, že Jiřická nádrž hostí vzácné a chráněné druhy a jako centrální vodní prvek území je důležitá pro okolní rašeliniště udržováním vysokého stavu podzemní vody, hraje také významnou roli v povodí římovské nádrže. Jednou z hlavních priorit kraje tak zůstává zachovat vysokou kvalitu pitné vody. Vodní toky z oblasti Přírodního parku Novohradské hory totiž reprezentují 60 % objemu vody přitékající do nádrže Římov, a je proto nutné sledovat a chránit i další horské nádrže z tohoto území. Jiřická nádrž tak představuje první precedens v tomto úsilí.

„Dohodli jsme se na tom, že budeme s krajem úzce spolupracovat. Aktuálně připravíme návrh na složení rybí obsádky a vhodného hospodaření na Jiřické nádrži,“ říká Jiří Peterka, ředitel Hydrobiologického ústavu Biologického centra AV ČR. Dalším krokem by měla být podrobná inventarizace druhů rostlin a živočichů, které jsou v prostředí Jiřické nádrže a okolí. Odborníci se také zúčastní plánované schůzky se starosty obcí s rozšířenou působností z Novohradska, kde se bude řešit, jak co nejlépe chránit zdroje v celém povodí vodárenské nádrže Římov. Panuje shoda, že je velmi žádoucí nově zahrnout i určitá režimová opatření v horní části povodí nádrže Římov, která budou limitovat eutrofizaci nádrží a toků v této oblasti.

 

Inovace ve sledování povodí

Spolupráce Jihočeského kraje s českobudějovickými vědci bude dále směřovat i k dalším inovacím. „Slíbili jsme si, že budeme připravovat společné projekty do žádostí o granty s tematikou udržení kvalitní pitné vody. Cílíme na inovativní metody monitoringu povodí, abychom mohli předcházet následkům extrémních jevů, jako jsou povodně či sucha, na kvalitu vody. Budeme cílit i na to, abychom včas vysledovali nečekané události, jako je například intenzivní vnos živin do části povodí, třeba rybníka, a kraj tak mohl bezprostředně řešit problémové uživatele,“ vysvětluje Jiří Peterka.

 

Úvodní foto: Jiřická nádrž. Foto Petr Znachor, BC AV ČR

JU slaví úspěch s MSc. Vedranou Šlipogor, Ph.D., na 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau

S potěšením oznamujeme, že MSc. Vedrana Šlipogor, Ph.D., z Katedry zoologie PřF JU byla vybrána k účasti na prestižním 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau v oboru fyziologie/medicína ve dnech 25.–30. června 2023. Tento pozoruhodný úspěch podtrhuje výjimečný talent a nasazení Dr. Šlipogor v jejím oboru.

MSc. Vedrana Šlipogor, Ph.D., působí jako postdoktorandka na Jihočeské univerzitě, kde se zabývá evolučními otázkami v oblasti behaviorální ekologie, komparativní kognitivní etologie a zejména výzkumu osobnosti zvířat, a jejími souvislostmi s učením u primátů (kosmanů bělovousých) a podzemních hlodavců (rypošů lysých). Dr. Šlipogor studovala v oboru molekulární biologie na univerzitě v chorvatském Záhřebu, účastnila se několika výzkumných stáží ve Francii a Rakousku, dvou terénních sezón v Brazílii a doktorské studium v oboru biologie, stejně jako první postdoktorandské místo, absolvovala na Vídeňské univerzitě v Rakousku, poté se přestěhovala do České republiky na postdoktorandský pobyt na JU, kde se také podílí na výzkumu, vedení studentů a výuce. Za svůj výzkum získala Dr. Šlipogor několik postgraduálních stipendií a grantů, včetně postgraduálního stipendia L'ORÉAL-UNESCO Austria "For Women in Science".

Setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau, která probíhají od roku 1951, slouží jako celosvětově uznávaná platforma pro podporu výměny zkušeností mezi laureáty Nobelovy ceny a mladými vědci. Tato setkání se stala symbolem vědecké inspirace, výchovy nové generace vědců a budování trvalých sítí mladých vědců z celého světa.

Úspěch žádosti Dr. Šlipogor o účast na této akci je důkazem jejího mimořádného přínosu a potenciálu vycházející hvězdy v oboru fyziologie/medicíny. Tato jedinečná příležitost jí umožní navázat kontakt s 30–40 laureáty Nobelovy ceny a připojit se k váženému shromáždění 600 mladých vědců z celého světa. Setkání v Lindau poskytují jedinečné prostředí pro sdílení znalostí, rozšíření perspektiv a navázání spolupráce.

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích je na úspěch Dr. Šlipogor velmi hrdá, neboť je nejen ukázkou její individuální excelence, ale také odrazem závazku univerzity podporovat kulturu výzkumu a inovací. Její účast na této prestižní akci nepochybně posílí pověst JU jako centra vědeckých talentů a excelentního výzkumu.

Co nejsrdečněji blahopřejeme MSc. Vedraně Šlipogor, Ph.D., k tomuto výjimečnému úspěchu. Jsme přesvědčeni, že účast na 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau pro ni bude neocenitelnou zkušeností a nabídne jí jedinečné příležitosti k osobnímu i profesnímu růstu. S napětím očekáváme, jaké poznatky a inspiraci přinese JU a její vědecké komunitě.

Více informací o 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau a jeho účastnících naleznete zde.

Stay in touch
social media

Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

© 2024 University of South Bohemia
Cookies

1

0