On the cover of the EMBO journal! ''Dynamic coupling in the bacterial Sec translocon."
Faculty scientist Dr. Tomas Fessl led a research project that demonstrated the key role of fast protein dynamics in the mechanism of protein transport across membranes. The results, which were published in the January issue of theEMBO journal, were obtained in collaboration with teams from University of Bristol (Prof. Ian Collinson) and University of Leeds (Prof. Sheena Radford, FRS) and involved local colleagues Dr. Joel Crossley and Prof. Roman Tuma.
The machinery behind the protein transport investigated in this study is the ubiquitous Sec translocon, a highly conserved membrane assembly for polypeptide transport across, or into, lipid bilayers. In bacteria, secretion through the core channel complex—SecYEG in the inner membrane—is powered by the cytosolic ATPase SecA. While individual parts of the molecular machinery are well known, the mechanism by which SecYEG adapts to and performs these various tasks remains unresolved. Prior to this publication the prevailing view favoured direct coupling between the ATPase and translocation, the so-called power stroke mechanism.
In collaboration with the groups of Prof. Ian Collinson (Bristol, United Kingdom) and Prof. Sheena Radford (Leeds, United Kingdom), local researchers developed a state-of-the-art single-molecule essay for quantitative detection and analyses of Sec translocon dynamics. Investigation of the translocon dynamics in different nucleotide states of SecA revealed that SecYEG channel is subject to rapid opening and closing on a much faster time scale than that of the SecA ATPase turnover. Such dynamic coupling of SecA ATPase to the SecYEG channel opening is incompatible with the directly coupled, power stroke models and instead favours a Brownian-ratchet mechanism of translocation which relies on pre-protein diffusion through the pore.
The research team further exploited the well characterised mutant of SecY (PrlA4) to test the Brownian-ratchet mechanism. This variant exhibits faster transport while its ATPase rate remains the same, an observation compatible only with the Brownian-ratchet mechanism. Furthermore, the mutation increases the time the channel spends in the open state, facilitating pre-protein diffusion through the pore and thereby enhancing translocation efficiency. This finding links SecYEG channel dynamics with its biological function, i.e. protein transport.
Such a dynamic allosteric mechanism is not unique to the SecYEG translocon, since similar nucleotide-dependent modulation of rapid dynamics has been recently shown for adenylate kinase, and the AAA+ ring ATPase, ClpB. However, SecYEG is the first membrane complex for which dynamic allostery was demonstrated.
The local group was funded by the European Regional Development Fund-Project (CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000441) and the Czech Science Foundation (20-11563Y) and collaborative funding from BBSRC (BB/T008059/1). Additional funds for collaborating partners were provided by BBSRC (BB/V001531/1 and BB/T006889/1) and Royal Society Professorial Research Fellowship (RSRP\R1\211057).
Contact: Mgr. Tomáš Fessl, Ph.D. (fessl at prf.jcu.cz)
Picture: Illustration of Sec translocon transporting preprotein across inner bacterial membrane
DOI:10.1038/s44318-023-00004-1
Skryté hodnoty přírodního a kulturního dědictví nejenom v historických zahradách
Historickým zahradám a parkům je tradičně věnovaná pozornost především památkové péče, nicméně i ochrana přírody zde má zájmové objekty. Jedná se zatím o spíše přehlížené biokulturní dědictví, které však nenávratně mizí stále se zrychlujícím tempem.
Náplní kurzu budou jednotlivé přednášky věnované vývoji v čase (od klášterní zahrady ke krajinářskému parku), zahradní tvarosloví na jihočeských příkladech, inspirace z ciziny, regionální odlišnosti, způsoby obnovy i to, jak historické parky ovlivnily skladbu sídelní zeleně. Součástí kurzu budou dvě exkurze. Podíváme se do Terezina údolí u Nových Hradů, které je odrazem evropské sentimentální malebnosti, romantismu i osvícenství, a na moderní park na Hluboké uchovávající tradiční funkce i v nastupujícím věku industriální racionality.
Zaměření jednotlivých lekcí:
1) Od klášterní zahrady ke krajinářskému parku: Zahrada - park - krajina - vývoj historického parku v čase, zahradní tvarosloví na jihočeských příkladech
2) Lednicko-valtický areál a Veltrusy: odlišné a přesto podobné inspirace v nejrozsáhlejších krajinných kompozicích v ČR
3) Česká Loara v kontextu parků moravského úvalu a slezského prstence
4) Sbírkové parky jsou součástí biokulturní rozmanitosti ale mimo arboreta nám doslova mizí před očima.
5) Současný stav historických parků, jejich zdařilé a méně zdařilé obnovy. Patří do historického parku golfové hřiště?
6) Parky formují dřeviny a zkrášlují byliny a drobná architektura. Městské parky a hřbitovy a jejich zeleň.
Exkurze 1 - Terezino údolí u Nových Hradů odrazem evropské sentimentální malebnosti, romantismu i osvícenství
Exkurze 2 - Moderní park na Hluboké uchovává tradiční funkce i v nastupujícím věku industriální racionality
Kurzem provází doc. RNDr. Tomáš Kučera, Ph.D., který se na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích zabývá krajinnou ekologií, ochranou přírody a kulturní krajiny, vlivem zeleně na biodiverzitu, sídelní krajiny, péče o přírodní a kulturní dědictví krajiny. Věnuje se také přednáškové a popularizační činnosti.
Začátek kurzu: 4.10. pak každou následující středu až do konce listopadu
Kdy: 16:00 do 18:00
Kde: Areál PřF JU, Branišovská ČB, Budova B, učebna B1
Přihlášky a dotazy posílejte na email Evy Gardianové: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Odkaz na elektronickou přihlášku: https://eshop.jcu.cz/simplifyworks/eoc/programs/362163744
Žádost o podporu EMBO grantů pro Českou republiku formou navýšení počtu udělovaných EMBO instalačních grantů na úroveň dvou až tří nově podpořených osob ročně a zajištění finančních prostředků k jejich realizaci ze státního rozpočtu
OTEVŘENÝ DOPIS MINISTRU ŠKOLSTVÍ: ČR potřebuje každoročně udělit minimálně dva až tři @EMBO Instalační granty v oblasti věd o živé přírodě, aby udržela krok se světem.
Pokud se tak nestane, riskujeme prohlubování tzv. inovační mezery. #SupportEMBOGrants
http://bit.ly/EMBO_OpenLetter
Vážený pane ministře,
dovolujeme si Vás kontaktovat ve věci zajištění dostatečné podpory pro EMBO instalační
granty (dále: EMBO IG) a navýšení počtu udělovaných grantů pro vědce a vědkyně včetně
zajištění potřebné výše finančních prostředků k jejich spolufinancování ze státního rozpočtu.
EMBO IG mají obrovský význam pro pozitivní systémovou změnu českého vědeckého
prostředí. Podpoření vědci a vědkyně dnes tvoří špičku českého výzkumu s mezinárodním
renomé. Svými mezinárodními zkušenostmi, progresivním myšlením a sdílenými hodnotami
programu EMBO představují velkou naději pro systémovou změnu v české vědě směrem
k evropskému standardu.
Nedostatečná podpora EMBO IG je v rozporu s dlouhodobým strategickým zájmem České
republiky a ztěžuje dosažení cílů Inovační strategie České republiky 2019–2030. Dosavadní
zkušenost s EMBO IG ukazuje hmatatelný intelektuální, materiální a finanční přínos pro Českou
republiku a českou společnost. Pro udržení mezinárodní vědecké konkurenceschopnosti České
republiky a budování značky evropského inovativního lídra je nezbytné využít všechny prostředky
pro přilákání mozků a zvyšování zastoupení excelentních výzkumníků a výzkumnic z českých
institucí v mezinárodní vědecké komunitě.
Dosavadní zkušenosti s účastí ČR v EMBO programu zřetelně ukazují na pozitivní dopad na
kvalitu vědy produkované v ČR, kultivaci vědeckého prostředí a větší integraci ČR do Evropského
výzkumného prostoru (ERA). Držitelé EMBO IG se svými inovativními výzkumnými projekty
následně také dosahují úspěchu v mezinárodních vysoce kompetitivních soutěžích a do ČR
přinášejí nejen prestižní mezinárodní granty (ERC, MSCA, Welcome Trust aj.), ale také privátní
zdroje na národní i mezinárodní úrovni. Při relativně malém objemu prostředků nutných
k podpoře programu se tak jedná o skutečně efektivní a strategickou investici, která má
dalekosáhlý dopad na kompetitivnost české vědy v mezinárodním měřítku.
https://vedavyzkum.cz/politika-vyzkumu-a-vyvoje/politika-vyzkumu-a-vyvoje/vedci-zadaji-ministra-skolstvi-o-podporu-embo-grantu
Celý text CZE v pdf zde: Otevřený dopis
Open letter to the Minister of Education, Youth and Sports
Akademický senát PřF JU na zasedání dne 29. 11. 2022 jednomyslně schválil návrh
prof. RNDr. Františka Váchy, Ph.D. na funkci děkana Přírodovědecké fakulty na období od 1. 4. 2023 do 31. 3. 2027.
Přírodovědecká fakulta přeje všem kolegům, studentům, partnerům a přátelům úspěšný rok 2024.
The Faculty of Science wishes all colleagues, students, partners and friends a successful and happy year 2024.
změna interiéru přízemí budovy B
Vedení PřF se rozhodlo provést změny interiéry přízemí budovy B za účelem vytvoření pohodlnějšího a přívětivějšího prostoru pro studenty, pořádání akcí fakulty i konferencí. Zde si můžete prohlédnout vizualizaci projektu architektonické studie připravené studiem Debyt. Také zde naleznete výsledky dotazníku, který oslovil studenty PřF a zjišťoval využívání a požadavky na tento prostor. Pokud máte jakékoliv další náměty a komentáře k plánovaným změnám neváhejte oslovit akademický senát PřF (This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.).
- Galerie:
- images/PRF/20200916_091508.jpg,
- images/PRF/oblik-2020.jpg,
Fakulta životního prostředí České zemědělské univerzity v Praze a Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity vydala publikaci Plužiny. Historické polní systémy České republiky. Jde o kritický katalog ke stejnojmenné výstavě. Česká a anglická jazyková mutace knihy shrnuje přístupným způsobem široké odborné veřejnosti výsledky pětiletého projektu týmu krajinných ekologů, archeologů a historických geografů téma historických polních systémů. Dochované pozůstatky historických zemědělských plužin jsou cennými historickými artefakty a kulturním dědictvím, ale rovněž hodnotnými přírodními stanovišti s vysokou estetickou hodnotou. Relikty středověkých plužin představuji svědectví o historickém osidlovaní a hospodařeni. Jsou hmatatelnou ilustraci středověké organizace půdního fondu v návaznosti na sídla a základem, od kterého se odvozuje dnešní pozemková držba. V relativně nezměněné podobě přežily několik století pod vlivem různých politických a ekonomických systémů a lze je označit za jedny z nejmalebnějších krajin ve střední Evropě. Jsou kulturně historickým dědictvím vzniklým díky tradičním způsobům využívaní půdy.
Kniha je dostupná v PDF verzi na stránkách obou univerzitních pracovišť. Tištěná verze bude k dispozici koncem měsíce října 2022.
Kniha - kritický katalog ke stejnojmenné výstavě je na tomto odkazu.
Zveme všechny zájemce na Podzimní BIO soustředění - Běstvinu. Soustředění je určené především pro středoškolské řešitele Biologické olympiády ze všech koutů ČR, ale v případě volné kapacity je účast otevřená i dalším zájemcům.
Pokladna bude uzavřena z technických důvodů. Děkujeme za pochopení.
Studenti PřF JU nabízejí ZDARMA pomoc při přípravě na maturitu z matematiky. Kontakt: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Srdečně vás zveme na populárně naučnou přednášku Termojaderná fúze a projekt ITER, která se uskutečni jako tradičně v posluchárně C2 od 16:00 ve čtvrtek 24.11.2022. Přednášet bude doc. Mlynář z FJFI CVUT v Praze.
V současné době probíhá kompletace fúzního reaktoru ITER, což je jeden z vůbec největších projektů mezinárodního výzkumu. V přednášce krátce připomeneme historii lidského úsilí o zvládnutí temojaderné fúze a vysvětlíme náročné fyzikální podmínky, které musí fúzní reaktor splňovat. Hlavním cílem přednášky je ilustrovat současný stav poznání v tomto oboru a dostupnost potřebných technologií. Závěrem přednášky budeme diskutovat roli termojaderné fúze jako potenciálního energetického zdroje.
Za organizační tým
Petr Jelínek, UFY
Přihlašte se na DVPP programy PřF JU v oborech: matematika, informatika, chemie, fyzika a biologie.
Přihlášky přijímáme do 31. 7. 2022!
Pozorování částečného zatmění Slunce pod taktovkou katedry fyziky se zúčastnili studenti a zaměstnanci naší fakulty (pozn.: pod taktovkou bylo pouze pozorování, se zatměním nemáme nic společného). Použili jsme katedrální čočkový dalekohled Celestron Omni XLT-120 osazený hranolem pro pozorování Slunce.
Další fotografie na facebooku katedry fyziky.
Byla spuštěna možnost se přihlásit na některou z výprav letošního ročníku "Exkurze do divočiny 2023" pořádaných Hnutím Duha. Exkurze povedou kromě klasicky navštěvovaných míst Šumavy nově i třeba do NP České Švýcarsko nebo Jizerských hor. "Studenti a zaměstnanci PřF, kteří se zúčastnili předchozích ročníků, měli veskrze pozitivní ohlasy. Jedná se o skvělou příležitost navštívit a intenzivněji poznat zajímavá místa s jedinečnou přírodní hodnotou. Účast vřele doporučuji všem nehledě na odborné zaměření.", zve případné zájemce k registraci Jaroslav Vrba, vedoucí Katedry biologie ekosystémů. Více informací od pořadatele exkurzí níže.
Exkurze do divočiny 2023
Přidejte se v létě na poznávací a zážitkové exkurze Hnutí DUHA do divoké přírody!
I letos připravujeme tradiční výpravy se zkušenými odbornými průvodci do známých i neznámých zákoutí šumavské divočiny: na jih k nejvyšší hoře české Šumavy Plechému a Plešnému jezeru i na neobjevené pomezí Vojenského prostoru Boletice, k tajemným šumavským vodám a proslulému Boubínu, ale i na centrální Šumavu na Šumavské pláně a do sousedního Bavorského lesa. Přicházíme i s netradiční Velkou putovní exkurzí napříč NP Bavorský les – čtyřmi dny pro dobrodruhy v divočině těsně za našimi hranicemi s velkým batohem na zádech.
A letos s námi zcela nově můžete vyrazit i do nešumavské divoké přírody: do NP České Švýcarsko, do míst plánovaného NP Křivoklátsko nebo do NPR Jizerskohorské bučiny (jediné české přírodní památky UNESCO). Podrobnosti najdete v nabídce na www.hnutiduha.cz/exkurze
Ilustrační foto: KBE
Zpět na: Aktuálně z katedry
