• Úvod
  • PŘF - Přírodovědecká fakulta JU

Jihočeští vědci objevili nové kmeny bakterií, kterými se zabývá celý svět

Bakterie jsou na Zemi všudypřítomné a výrazně ovlivňují život všech živočichů, včetně člověka. Zároveň jsou schopné někdy až neuvěřitelné adaptace na okolní prostředí a svého hostitele. Z tohoto důvodu je výzkum evoluce bakterií velmi důležitý pro pochopení toho, jaký účinek mohou mít bakterie na hostitelský organismus a jak se proti nim eventuálně bránit či je naopak lépe využít v léčbě. Vědcům z Přírodovědecké fakulty JU se nyní podařilo dosáhnout ve výzkumu evoluce bakterií významného objevu. Důkazem je fakt, že objev zveřejnil prestižní vědecký časopis Microbiome.

Práce vědců PřF JU se týká wolbachií, velmi hojných bakterií, které se často vyskytují v mikrobiomech bezobratlých živočichů a projevují se širokým spektrem životních stylů od parazitismu po mutualismus, tedy oboustranně výhodnou symbiózu.

Schopnosti wolbachií ovlivňovat organismus hostitele jsou přitom natolik fascinující, že se těmi bakteriemi zabývají v širokém měřítku vědecká pracoviště na celém světě.

Některé druhy wolbachií například dokáží ovlivnit rozmnožování svých hostitelů. A to tak, že samečci určitých druhů hmyzu, nakažení wolbachiemi, mohou mít potomstvo pouze se stejně nakaženými samičkami. A tyto bakterie umí i jinými způsoby manipulovat s reprodukčním potenciálem hostitele.

Některé wolbachie mají ale pro hostitelský organismus zásadně pozitivní význam, jsou to „mutualisté“, bez nichž se hostitel ve svém životě neobejde.

Vědci z Přírodovědecké fakulty JU se ve svém výzkumu zabývali skupinou wolbachií, označovanou písmenem F a mezi biology považovanou za biologicky obzvlášť zajímavou. A ačkoliv je tedy tato skupina už dlouho v hledáčku různých vědeckých pracovišť, podařilo se jihočeským vědcům objevit v této skupině pomocí sekvencí DNA a fluorescenčního zobrazení 5 dosud neobjevených kmenů wolbachií. A to v mikrobiomu čtyř druhů všenek. Pozoruhodný je však především fakt, že genomy těchto nově objevených wolbachií dosáhly různých evolučních stádií a představují dva pozoruhodně odlišné typy genomu symbionta.

Zatímco první tři z těchto genomů se podobají jiným známým členům skupiny F, další dva jsou zřejmě v evoluční přeměně dále a vykazují známky pokročilé deaktivace a odstraňování genů.

„Aby se v průběhu evoluce mohla stát wolbachie pro hostitelský organismus prospěšným symbiontem, postupně ztrácela některé geny, které se v tomto procesu ukázaly jako nepotřebné, případně by hostiteli mohly škodit. Genom se tak postupně zmenšoval,“ řekl portálu ScienceZoom vedoucí výzkumného týmu Václav Hypša.

Příkladem takového „evolučního zmenšování“ genomu byl zejména symbiont „wMeur1“, jeden z pěti nově objevených kmenů wolbachií, detekovaných jihočeskými vědci ve všenkách. „Genom kmene wMeur1 z mikrobiomu všenek představuje v současnosti nejmenší známý genom wolbachie a první příklad wolbachií, které dokončily proces zmenšení svého genomu směrem k co nejefektivnější symbióze s hostitelem,“ řekl Hypša.

O tom, že se tento konkrétní kmen wolbachie skupiny F postupně přizpůsoboval soužití s hostitelským organismem, svědčí mimo jiné fakt, že „wMeur1“ převzal od jiných bakterií z vnějšku geny, schopné produkovat pro všenky životně důležitý vitamín. „To poukazuje na to, že navzdory velkému množství a velké rozmanitosti známých kmenů wolbachie zůstává evoluční potenciál wolbachií nedostatečně prozkoumaný,“ píší autoři v závěru své zprávy.

Objev jihočeských vědců otevírá cestu k dalšímu výzkumu těchto bakterií, které jsou pro své evoluční schopnosti předmětem vědeckého zkoumání na celém světě. Poznání toho, jak tyto bakterie přesně fungují a přizpůsobují se organismům svých hostitelů nebo ho samy ovlivňují, totiž může vést například i pokroku v medicíně či biologii. V případě objevu týmu PřF JU je navíc důležité, že pět různých, nově objevených kmenů wolbachií skupiny F, se nachází v různých evolučních stádiích a je tedy je možné mezi sebou porovnávat a dokumentovat směr evolučního procesu. Význam práce jihočeských vědců podtrhuje právě fakt, že jejich studii zveřejnil prestižní časopis Microbiome.

bakterie_clanek

Autor textu: Marek Kerles

Jihočeští vědci se podíleli na významném objevu

Spolupráce vědců z Michigan State University, University of California Berkeley, Lawrence Berkeley National Laboratory, Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a Biologického centra AV ČR vedla k významnému objevu v oblasti fotosyntézy.

Studie, na níž se podíleli také Tomáš Polívka a David Bína z Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a Biologického centra AV ČR, byla 31. srpna publikována v nejprestižnějším vědeckém časopise Nature.

Fotosyntéza je klíčový proces pro udržení života na planetě, jelikož je jako jediný schopen zpracovávat sluneční energii a převádět ji na jiné formy energie, které živé organismy včetně člověka mohou využívat. Jelikož veškerá potrava je fotosyntetického původu, ať už jako primární produkt (ovoce, zelenina, obilí, …) nebo jako produkt sekundární (maso, mléko, …), je detailní pochopení fotosyntetických procesů zásadní nejen pro základní výzkum, ale i pro zvládnutí společenských výzev jako například zajištění dostatku potravin pro stále se zvyšující populaci na planetě.

Fotosyntézu máme dnes spojenou především se zelenými rostlinami, ale využívat sluneční záření pomocí fotosyntézy umí i jednodušší organismy, jako jsou například sinice. A právě na tyto jednodušší organismy cílí publikovaná studie. Všechny fotosyntetické organismy mají speciální útvary složené z proteinů, jejichž jediným úkolem je zachytit sluneční záření a získanou energii odevzdat dalším proteinům, které ji přemění na chemickou energii. Tyto útvary, které se nazývají světlosběrné antény, jsou u sinic velmi specifické, a jejich detailní struktura a mechanismus přenosu energie nebyly dosud známé.

Devítičlennému týmu složenému z odborníků na elektronovou mikroskopii, strukturní biologii, molekulární biologii a biofyziku se nyní podařilo tyto antény sinic do detailu popsat a zobrazit. Navíc, detailní znalost struktury umožnila zjistit, jak se zachycená energie celým systémem přenáší. Tuto analýzu provedli právě jihočeští vědci. „Měli jsme štěstí, že jsme vytvořili tým odborníků z různých oborů, kteří se skvěle doplňovali. Celá skupina měla tu správnou chemii“ říká Cheryl Kerfeld, profesorka strukturního bioinženýrství na Michigan State University, která celý projekt vedla. „Výsledkem je jedenáct stran objevů a překvapení“ doplňuje Maria Agustina Domínguez-Martín, první autorka publikace. Prostor, který časopis Nature této studii dal, je mimořádný, jelikož většina publikací v tomto prestižním časopisu má rozsah zhruba poloviční. To jen podtrhuje význam práce mezinárodního týmu vědců.

Kromě pochopení struktury a funkce světlosběrných antén sinic totiž studie obsahuje ještě další významný objev. Všechny fotosyntetické organismy se potýkají s problémem, jak ochránit svůj fotosyntetický aparát, když je světla příliš mnoho. U sinic bylo již dlouhou dobu známo, že za regulaci toku energie odpovídá malý protein zvaný OCP (z anglického Orange Carotenoid Protein), ale dosud nebylo vůbec jasné, jak tento protein funguje. Mezinárodnímu týmu vědců se pomocí elektronové mikroskopie podařilo odhalit místa, kde se tento malý protein váže na anténu. To byl první zásadní krok k pochopení mechanismu, jak tento protein může ovlivnit tok energie v mnohonásobně větší světlosběrné anténě. Následné modelování přenosu energie, které bylo výsledkem práce jihočeských vědců, mechanismus akce tohoto proteinu spolehlivě vysvětlilo. Celý systém je optimalizován tak, že OCP protein odebere přebytečnou energii z antény a bezpečně ji převede na teplo. „Velmi si vážím možnosti pracovat v tomto skvělém týmu“ říká Tomáš Polívka, profesor biofyziky na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity, který s Cheryl Kerfeld spolupracuje již téměř dvacet let. „Vidět poprvé strukturu celého systému byl neskutečný zážitek. Hned bylo jasné, že je to zásadní průlom, který nám umožní do detailu pochopit, jak systém funguje“, doplňuje.

Pochopení struktury a mechanismu zachycování a regulace světelné energie v sinicích je průlomovým objevem zejména proto, že je to poprvé v historii fotosyntetického výzkumu, kdy je možné „vidět“ jak nějaký fotosyntetický organismus omezuje svůj výkon v případě nadměrného množství světla. Studie je výchozím bodem pro další výzkum, včetně možných aplikací v oblasti umělé fotosyntézy, biotechnologií využívajících sinic například pro získávání specifických látek nebo i omezení nežádoucího výskytu sinic na vodních plochách.

Odkaz na publikaci: Dominguez-Martin, M.A., Sauer, P.V., Kirst, H., Sutter, M., Bína, D., Greber, B.J., Nogales, E., Polívka, T., Kerfeld, C.A. Structures of a phycobilisome in light-harvesting and photoprotected states. Nature 2022.

https://www.nature.com/articles/s41586-022-05156-4 <

Kontakt: prof. Tomáš Polívka, Katedra fyziky, Přírodovědecká fakulta JU, Branišovská 1760, 37005 České Budějovice; tel. 777 729 590; e-mail: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

 

nature

Umělecké ztvárnění světlosběrného aparátu sinic. Základní složky antény jsou znázorněny modře a zeleně, OCP protein je v oranžové barvě. © Janet Iwasa, University of Utah.

Jiřická nádrž v Novohradských horách dostane efektivnější ochranu, slíbil jihočeský hejtman vědcům

Schůzka jihočeského hejtmana Martina Kuby s vědci z Biologického centra Akademie věd ČR a Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích, kteří v červnu předali na Jihočeský kraj výsledky petice za ochranu Jiřické nádrže v Novohradských horách s více než dvěma tisíci podpisy, přinesla ovoce. Odborníci se s vedením kraje shodli na tom, že tato rašelinná nádrž, pocházející z roku 1774, potřebuje efektivnější status ochrany. Jak hejtman sdělil, odbor životního prostředí kraje má v plánu zahájit práce na přípravu vyhlášení Jiřické nádrže formou samostatné zvláštní územní ochrany. Reálný předpoklad vyhlášení zvláště chráněného území je do tří let. S tím souvisí i nastavení nového způsobu hospodaření, odpovídající moderním požadavkům na péči o chráněná území. To je důležité nejen pro zachování přírodní rozmanitosti a vzácných druhů živočichů v srdci Novohradských hor, zachování krajinného rázu a prostupnosti a přístupnosti krajiny, ale také pro udržení vysoké kvality pitné vody pro Českobudějovicko, protože jde o území v povodí vodárenské nádrže Římov.

Velké obavy o osud této nádrže s charakterem přírodního horského jezera mají jihočeští hydrobiologové kvůli komerčním aktivitám soukromého vlastníka, který v Jiřické nádrži provozuje rekreační rybolov a vysazuje pro horský ekosystém zcela nevhodné, nepůvodní a nežádoucí druhy ryb. Následkem tohoto nepřiměřeného rybářského využití dochází k ničení přírodních hodnot této unikátní lokality, včetně pustošení vzácných živočichů, jako jsou obojživelníci či ohrožené střevle potoční. (Komerční rybolov devastuje ohrožené druhy v srdci Novohradských hor. Jihočeští vědci volají po ochraně Jiřické nádrže)

Ve své petici adresované zastupitelům a hejtmanovi Jihočeského kraje odborníci původně požadovali, aby byla Jiřická nádrž zahrnuta do území nově vyhlášené Přírodní památky Pohoří na Šumavě. K tomu však nedojde. „Vyjasnili jsme si, že z procesních důvodů je velmi problematické do této přírodní památky nyní nádrž zařadit. Nicméně mezi námi panuje jednoznačná shoda na tom, že Jiřická nádrž a její bezprostřední okolí má mít efektivnější statut ochrany a že se na tom bude pracovat,“ říká ředitel Biologického centra AV ČR Libor Grubhoffer. Lepší úroveň ochrany, ať se bude jednat o přírodní památku, území se statutem ochrany vod či jiné, by se měla vyhlásit do tří let. Ve hře také zůstává vyhlášení chráněné krajinné oblasti, zmínil jihočeský hejtman.

 

Hospodaření v Jiřické nádrži, ale i v dalších horských nádržích v Novohradských horách má zásadní vliv na kvalitu pitné vody z nádrže Římov

Kromě toho, že Jiřická nádrž hostí vzácné a chráněné druhy a jako centrální vodní prvek území je důležitá pro okolní rašeliniště udržováním vysokého stavu podzemní vody, hraje také významnou roli v povodí římovské nádrže. Jednou z hlavních priorit kraje tak zůstává zachovat vysokou kvalitu pitné vody. Vodní toky z oblasti Přírodního parku Novohradské hory totiž reprezentují 60 % objemu vody přitékající do nádrže Římov, a je proto nutné sledovat a chránit i další horské nádrže z tohoto území. Jiřická nádrž tak představuje první precedens v tomto úsilí.

„Dohodli jsme se na tom, že budeme s krajem úzce spolupracovat. Aktuálně připravíme návrh na složení rybí obsádky a vhodného hospodaření na Jiřické nádrži,“ říká Jiří Peterka, ředitel Hydrobiologického ústavu Biologického centra AV ČR. Dalším krokem by měla být podrobná inventarizace druhů rostlin a živočichů, které jsou v prostředí Jiřické nádrže a okolí. Odborníci se také zúčastní plánované schůzky se starosty obcí s rozšířenou působností z Novohradska, kde se bude řešit, jak co nejlépe chránit zdroje v celém povodí vodárenské nádrže Římov. Panuje shoda, že je velmi žádoucí nově zahrnout i určitá režimová opatření v horní části povodí nádrže Římov, která budou limitovat eutrofizaci nádrží a toků v této oblasti.

 

Inovace ve sledování povodí

Spolupráce Jihočeského kraje s českobudějovickými vědci bude dále směřovat i k dalším inovacím. „Slíbili jsme si, že budeme připravovat společné projekty do žádostí o granty s tematikou udržení kvalitní pitné vody. Cílíme na inovativní metody monitoringu povodí, abychom mohli předcházet následkům extrémních jevů, jako jsou povodně či sucha, na kvalitu vody. Budeme cílit i na to, abychom včas vysledovali nečekané události, jako je například intenzivní vnos živin do části povodí, třeba rybníka, a kraj tak mohl bezprostředně řešit problémové uživatele,“ vysvětluje Jiří Peterka.

 

Úvodní foto: Jiřická nádrž. Foto Petr Znachor, BC AV ČR

JU slaví úspěch s MSc. Vedranou Šlipogor, Ph.D., na 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau

S potěšením oznamujeme, že MSc. Vedrana Šlipogor, Ph.D., z Katedry zoologie PřF JU byla vybrána k účasti na prestižním 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau v oboru fyziologie/medicína ve dnech 25.–30. června 2023. Tento pozoruhodný úspěch podtrhuje výjimečný talent a nasazení Dr. Šlipogor v jejím oboru.

MSc. Vedrana Šlipogor, Ph.D., působí jako postdoktorandka na Jihočeské univerzitě, kde se zabývá evolučními otázkami v oblasti behaviorální ekologie, komparativní kognitivní etologie a zejména výzkumu osobnosti zvířat, a jejími souvislostmi s učením u primátů (kosmanů bělovousých) a podzemních hlodavců (rypošů lysých). Dr. Šlipogor studovala v oboru molekulární biologie na univerzitě v chorvatském Záhřebu, účastnila se několika výzkumných stáží ve Francii a Rakousku, dvou terénních sezón v Brazílii a doktorské studium v oboru biologie, stejně jako první postdoktorandské místo, absolvovala na Vídeňské univerzitě v Rakousku, poté se přestěhovala do České republiky na postdoktorandský pobyt na JU, kde se také podílí na výzkumu, vedení studentů a výuce. Za svůj výzkum získala Dr. Šlipogor několik postgraduálních stipendií a grantů, včetně postgraduálního stipendia L'ORÉAL-UNESCO Austria "For Women in Science".

Setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau, která probíhají od roku 1951, slouží jako celosvětově uznávaná platforma pro podporu výměny zkušeností mezi laureáty Nobelovy ceny a mladými vědci. Tato setkání se stala symbolem vědecké inspirace, výchovy nové generace vědců a budování trvalých sítí mladých vědců z celého světa.

Úspěch žádosti Dr. Šlipogor o účast na této akci je důkazem jejího mimořádného přínosu a potenciálu vycházející hvězdy v oboru fyziologie/medicíny. Tato jedinečná příležitost jí umožní navázat kontakt s 30–40 laureáty Nobelovy ceny a připojit se k váženému shromáždění 600 mladých vědců z celého světa. Setkání v Lindau poskytují jedinečné prostředí pro sdílení znalostí, rozšíření perspektiv a navázání spolupráce.

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích je na úspěch Dr. Šlipogor velmi hrdá, neboť je nejen ukázkou její individuální excelence, ale také odrazem závazku univerzity podporovat kulturu výzkumu a inovací. Její účast na této prestižní akci nepochybně posílí pověst JU jako centra vědeckých talentů a excelentního výzkumu.

Co nejsrdečněji blahopřejeme MSc. Vedraně Šlipogor, Ph.D., k tomuto výjimečnému úspěchu. Jsme přesvědčeni, že účast na 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau pro ni bude neocenitelnou zkušeností a nabídne jí jedinečné příležitosti k osobnímu i profesnímu růstu. S napětím očekáváme, jaké poznatky a inspiraci přinese JU a její vědecké komunitě.

Více informací o 72. setkání laureátů Nobelovy ceny v Lindau a jeho účastnících naleznete zde.

Jubilejní desátý ročník prestižního FEBS praktického krystalizačního kurzu

Laboratoř strukturní chemie Katedry chemie vedená prof. Ivanou Kutou Smatanovou připravuje jubilejní desátý ročník prestižního FEBS praktického krystalizačního kurzu, který se bude konat na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích od 9. do 15. června 2024.

Tento kurz má bohatou historii, která sahá až dvacet let zpět, kdy se na Jihočeské univerzitě v Českých Budějovicích konal první FEBS kurz “Advanced methods in macromolecular crystallization I”, zaměřený na krystalizaci proteinů, jako i novinky a trendy v oboru proteinové krystalogeneze. Od té doby se stal tradicí a přilákal přes 300 studentů a postdoktorandů z celého světa.

Ani pandemie covid-19 nezastavila jeho pokračování, a v srpnu 2021 se uskutečnil devátý kurz ve zpřísněných podmínkách, ale v off-line režimu. Rentgenová difrakce zůstává stále zásadní metodou pro studium struktury biologických makromolekul, zejména komplexů protein-inhibitor / substrát. I přes pokroky v oblasti cryoEM jsou výzvy v krystalizaci biologických makromolekul pořád aktuální.

Cílem kurzu je překlenout propast mezi novými poznatky a praktickými dovednostmi. Studentům budou přednášet renomovaní odborníci, kteří poskytnou své cenné odborné znalosti a zkušenosti a tím navážou na úspěšnou tradici těchto kurzů. Studenty navíc seznámí s novými tématy jako je screening fragmentů, intracelulární krystalizace nebo cryoEM. Jsme si jisti, že diskuse o teorii spojena s laboratorními experimenty vytvoří jedinečný vzdělávací zážitek, který studentům poskytne nezapomenutelné zkušenosti a zážitky.

Více informací zde.

prof. Mgr. Ivana Kutá Smatanová, Ph.D. and co.

JuniUni - mikrobiolog

Co nám žije na mobilu a třeba na rukou? Odpověď na tuto otázku ve čtvrtek hledali středoškoláci během dalšího semináře Juniorské univerzity. Kurz s názvem mikrobiolog je zavedl do biochemické laboratoře. Tam se seznámili s principy sterilní práce, vyzkoušeli práci s laboratorním materiálem a bakteriemi. Na závěr si odebrali své vlastní vzorky a teď budou čekat, co zajímavého jim v petriho miskách naroste.

 

Celá nabídka kurzů JuniUni i dalšího vzdělávání zde: Centrum pro přírodovědné vzdělávání.

 

  

 

 

JuniUni – středoškoláci si zkouší, jak to chodí na Přírodovědě

Izolovat vlastní DNA, rozpitvat saranče, nebo zjistit, kolik kofeinu je v našich „oblíbených“ nápojích? To všechno zkouší tento týden účastníci Juniorské univerzity PřF JU. Téměř stovka středoškoláků si pod vedením pedagogů a studentů PřF JU zkouší nejrůznější laboratorní techniky.

  

V týdnu od 5. do 9. února se rozbíhají první letošní kurzy Juniorské univerzity. Studenti středních škol si tak mohou ozkoušet laboratorní cvičení molekulární biologie ve kterém si na vlastní oči prohlédnou chromosomy a porovnají, jak vypadají během různých fází dělení jádra buňky. Kdo má odvahu, může si při přípravě meiotických preparátů vyzkoušet pitvu sarančí a podívat se, jak takové saranče vypadá uvnitř.

V laboratoři aplikované biochemie si zase studenti střední zdravotnické školy vyzkoušejí dvě metody izolace DNA. Nejprve si vyizolují vlastní DNA z kapky krve, ze které následně zjistí, zda jsou nositeli mutantních genotypů enzymů odbourávajících alkohol. Ve druhé části praktik izolují plasmidové DNA pomocí metody alkalické lýzy.

A v neposlední řadě se podíváme na celosvětově nejvíce konzumovanou psychoaktivní látku „KOFFEIN“. Pomocí kapalinové chromatografie si studenti stanoví koncentrace kofeinu v nápojích, zjistí a porovnají obsah kofeinu v kávě, čaji a energetických nápojích.

V tomto týdnu u nás zažili „vejšku“ studenti z Českých Budějovic, Českého Krumlova, Prachatic, Volyně a dalších jihočeských měst. Další otevřené kurzy Juniorské univerzity JU čekají na své účastníky! Jejich seznam najdete zde: kurzy Juniorské univerzity JU 

    

  

 

JuniUni Jak pracuje půda a kdo v ní žije?

Jak pracuje půda a kdo v ní žije?

Odpověď na tuto otázku hledali studenti, kteří využili nabídky JuniUni a 4. dubna navštívili Půdní skupinu na Katedře biologie ekosystémů. Po krátké úvodní přednášce vyrazili do okolí fakulty, kde se na vlastnoručně odebraných půdních sondách v lese, na louce a na poli mohli přesvědčit o tom, jak moc způsob, kterým hospodaříme, ovlivňuje charakter půdy a její obyvatele. Odpoledne nahlédli do laboratoří a zázemí, kde si mohli vyzkoušet některé z jednoduchých a rychlých analýz půdy.

Nabídka workshopů JuniUni je dostupná na Centrum pro přírodovědné vzdělávání

 

 

 

Kandidáti navržení na funkci děkana Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích

Volební komise oznamuje členům akademické obce, že ve stanoveném termínu byli navrženi dva kandidáti na funkci děkana, prof. RNDr. František Vácha, Ph.D. a prof. RNDr. Jan Kaštovský, Ph.D.


Prof. Kaštovský svou kandidaturu odmítl. Prof. Vácha s kandidaturou souhlasil a členové akademické obce PřF JU mohou členům volební komise k jeho kandidatuře podat písemné připomínky do 29. listopadu 2022 do 12:00.

Představení prof. Váchy a jeho představ o dalším směřování PřF JU proběhne na shromáždění akademické obce PřF JU 29. listopadu 2022 od 16:00 v učebně B2 Blažkova pavilónu.

V Českých Budějovicích, 22. listopadu 2022

RNDr. Petr Nguyen, Ph.D.

za volební komisi

 

Přiložené dokumenty:

Plán aktivit volba děkana 2022

 CV. prof. RNDr. František Vácha, Ph.D.

Katedra biologie ekosystémů spolupořádala Den Země v Písku

Den Země byl příležitostí pro uspořádání mnoha akcí pro veřejnost, z nichž některé proběhly i za přispění naší fakulty. Jednou z nich byl festival Den Země v Písku 2023 pořádaný spolkem Aktivní Písek ve spolupráci s městem Písek. Organizátoři připravili bohatý program včetně vzdělávacího program pro žáky ZŠ a širokou veřejnost na téma "Půda nás baví", který zaštítily Ústav půdní biologie a biochemie Biologického centra AV ČR a naše Katedra biologie ekosystémů. Písečáci se tak na Alšově náměstí mohli seznámit s některými obyvateli půdy a nahlédnout do jejich světa nejen mikroskopem nebo například přístrojem na měření půdní respirace.

Půdaři z KBE připravili pro návštěvníky dvě zastavení. U prvního se zvídavci mohli dozvědět, jak široké spektrum organismů půdu obývá, čím jsou zajímaví a důležití a tedy proč je vlastně studovat. Druhý stánek se věnoval obnově šumavských rašelinišť, kterými se KBE dlouhodobě zabývá. Expozice mj. nabídla možnost si osahat rašelinu z nenarušeného i degradovaného rašeliniště, případně "potěžkat" množství vody, které je hrst rašeliny schopná zadržet. "Rašelináři" ještě přizvali spolupracovníky z Národního parku Šumava, se kterými v rámci projektu LIFE for MIRES sledují vývoj původně odvodněných rašelinišť po jejich revitalizaci. Kolemjdoucí tak mohli vedle "ponoření" pod povrch půdy hned vedle nahlédnout na tuto tematiku z vyšší perspektivy u interaktivního modelu povodí, který pomáhá pochopit, jak moc jsme v historii změnili vodní režim naší krajiny a jaké z toho plynou následky nejen pro půdu. Venkovní program doplnily přednášky o revitalizacích rašelinišť v písecké knihovně.

Půdaři z KBE děkují organizátorům festivalu a kolegům z ÚPBB za pozvání a spolupráci.

Foto: KBE a Markéta Kubátová (BC AV ČR)

Katedra medicínské biologie na Makerday

Poslední sobotu před prázdninami se Katedra medicínské biologie PřF JU ve spolupráci s Biologickým centrem AV zúčastnila Makerday na Sokolském ostrově. Akce byla určena všem zájemcům o umění, techniku a tvoření.

Návštěvníci si ve stanu Katedry medicínské biologie mohli prohlédnout klíšťata z blízka. Pod mikroskopem byla k vidění vývojová stádia klíšťat, jejich méně známé druhy a klíšťata po různé době sání. Návštěvníky zaujala i ukázka metody, pomocí které se z klíšťat získávají pro experimentální účely sliny.

Zájemci si dále mohli vyzkoušet zachránit buňku před infekcí. Prostřednictvím skládačky se návštěvníci dozvěděli, jak v lidském těle fungují virus neutralizační protilátky a jak buňky prezentují zachycený antigen. 

 

Kdo chce pochopit počasí, měl by zkusit život v oblacích... Aspoň na chvíli! - záznam populárně naučné přednášky

Alena Zárybnická své první mapy a snímky z družic stahovala z mezinárodního programu pomocí antény a přijímače z ponorky na faksimilový papír ze začátku 80. let. Dnes je 25 let v redakci počasí ČT. A podílí se i na dalších projektech redakce počasí, sportu či v Českém rozhlase. Je spoluautorkou knih (např. Skoro jasno či Když se blýská na časy), článků o počasí v časopisech a novinách, knihy rozhlasových rozhovorů Zálety Aleny Zárybnické a cestopisné knihy Alpami na kole.

 

yt  Pro ty z vás, kteří nestihli přednášku Aleny Zárybnické, nabízíme její záznam na Youtube kanálu katedry fyziky.

 

 2021-12-09_zarybnicka

Klub Wikipedie

Klub Wikipedie

 

Wikiklub neboli neformální setkání příznivců Wikipedie zve zájemce o editaci z řad studentů, zaměstnanců JU i veřejnosti, a to jak zkušené editory, tak i začátečníky.

Kde: místnost Klub v přízemí budovy Akademické knihovny Jihočeské univerzity (Branišovská 1646/31b, dále také AK JU)

Kdy: pokračujeme i v roce 2024, a to 1x měsíčně v čase 16:45–17:45. Termíny jsou plánovány na úterky kolem poloviny měsíce: 16. 1., 13. 2., 12. 3., 16. 4., 14. 5. a 18. 6.

K dispozici budou:

  • počítač a interaktivní tabule, židle a stoly pro 25 lidí, je možné donést si vlastní notebook, tablet apod. s možností připojení k wi-fi.
  • zjištěné chyby a nedostatky ve Wikipedii (kdybyste třeba neměli vlastní tipy, co editovat)
  • wikipedistka na konzultace obzvláště k Wikipedii a sesterským projektům Wikimedia Commons a Wikidata
  • zdroje knihovny (potřebujete-li je a nemáte registraci v AK JU, dejte prosím vědět předem, abychom je mohli zajistit)
  • toalety

Jak:

  • Účast na setkáních Wikiklubu je zdarma.
  • Není potřeba se předem nikam registrovat. Napíšete-li nám však, samozřejmě budeme rádi a na oznámené téma se připravíme.

Kdo: kontaktní osobou je wikipedistka Czeva (e-mail přes rozhraní Wikipedie, e-mail: czevawikimedia.cz)

    Kniha Věda je život, život není věda

    Eva Bobůrková, Radek Gális

    Kniha s názvem Věda je život, život není věda obsahuje rozhovory s osmi význačnými vědci Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích. Obsahuje autorské rozhovory s významnými vědci a odborníky, kteří dlouhodobě působili nebo stále ještě působí na Jihočeské univerzitě v Českých Budějovicích, a svou prací i zapojením do společenského života jsou pracovním i morálním příkladem pro současnou mladou generaci. Zpovídavými osobnostmi jsou pediatr a emeritní děkan Zdravotně sociální fakulty JU Miloš Velemínský (+2024), teolog, exulant a emeritní děkan Teologické fakulty JU Karel Skalický, biolog, emeritní rektor JU a současný ředitel Biologického centra Akademie věd ČR Libor Grubhoffer, botanik Jan Květ, psycholog a historik Milan Nakonečný, biolog a vedoucí terénní stanice na Papui Nové Guineji Vojtěch Novotný, bioložka a emeritní děkanka Přírodovědecké fakulty JU Hana Šantrůčková, parazitolog a emeritní ředitel Parazitologického ústavu Akademie věd ČR Julius Lukeš. Knihu s bohatou fotografickou přílohou opatřil úvodem první rektor Jihočeské univerzity doc. Jiří Divíšek. 

    Slavnostní prezentace knihy se uskuteční ve čtvrtek 11. dubna v 16.00 u Lavičky Václava Havla vedle rektorátu Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích za přítomnosti autorů, většiny respondentů i emeritní předsedkyně Akademie věd ČR a Učené společnosti ČR prof. Heleny Illnerové.   

    Kniha vydána ve spolupráci s nakladatelstvím Dauphin, 280 stran, ISBN 978-80-7645-526-9,

    doporučená cena 350 Kč, kontakt: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript., tel.: 602649292

      

    Kolik bobrů žije v Boleticích?

    Galerie:
    • images/PRF/fakulta/katedry/kbe/aktualne/2024/02_bobri/20230319_141617.jpg,
    • images/PRF/fakulta/katedry/kbe/aktualne/2024/02_bobri/20230504_103855.jpg,
    • images/PRF/fakulta/katedry/kbe/aktualne/2024/02_bobri/img_2220.jpg,
    • images/PRF/fakulta/katedry/kbe/aktualne/2024/02_bobri/img_2223.jpg,

    Student katedry biologie ekosystémů Vladislav Seidl se ve své bakalářské práci v sezóně 2021/22 věnoval monitoringu bobří populace ve vojenském újezdu Boletice. Zmapoval pobytové stopy bobrů a data následně vyhodnotil pomocí GIS softwaru. Výsledky odhalily, že se v Boleticích vyskytuje šest bobřích teritorií čítajících odhadem 34 jedinců. Celá práce byla následně zpracována do podoby článku do šumavského časopisu Silva Gabreta. Na bakalářskou práci student navázal výzkumem biodiverzity v bobřích a člověkem vytvořených tůních. S monitoringem se začalo v loňském roce a proběhl průzkum vodního hmyzu, plžů a ryb se zaměřením na ochranářsky významné druhy (tj. druhy z Červeného seznamu). Výzkum biodiverzity byl podpořen mimo jiné Studentskou grantovou agenturou (SGA) PřF JU. Nyní se intenzivně pracuje na zpracování vzorků a doufejme, že se i tyto výsledky podaří opublikovat! Na průzkumu se také podíleli vedoucí práce Vojtěch Kolář a na průzkumu ryb také další kolega z katedry Petr Blabolil.

    Originální článek v časopisu Silva Gabreta ZDE.

    Ilustrační foto: autoři studie

    Komerční rybolov devastuje ohrožené druhy v srdci Novohradských hor. Jihočeští vědci volají po ochraně Jiřické nádrže

    Jiřická nádrž, foto Petr Znachor BC AV ČR

    Velké obavy o osud Jiřické nádrže (Pohořského rybníka) v jádrové části Přírodní památky Novohradské hory mají hydrobiologové z Biologického centra Akademie věd ČR a Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích spolu s dalšími odborníky a veřejností. Tento jedinečný horský ekosystém malé říčky (Pohořský potok) a přibližně dvě stě let starého rašelinného rybníka se ještě donedávna vyznačoval čistou vodou a neporušenými přírodními poměry s původními druhy vzácných živočichů, včetně ohrožené střevle potoční. Komerční rybolov a vysazování velkých dravců, které se v nádrži v současné době provozuje, však významně ničí původní společenstva ryb i obojživelníků. Odborníci proto apelují na Krajský úřad Jihočeského kraje, aby Jiřická nádrž získala patřičnou ochranu a byla zahrnuta do připravované Přírodní památky Pohoří na Šumavě. K tomu založili také petici aePetici, v níž se mohou vyjádřit svým podpisem i občané.

    Podle jihočeských odborníků, kteří sledují povodí Jiřické nádrže už více než dekádu, je charakter, biologická hodnota a ekologická významnost této nádrže v jádrové části Přírodního parku Novohradské hory (téměř 900 m n. m.) na podobné úrovni, jako je tomu u rašelinného jezera Laka na Šumavě. Tomu bohužel neodpovídá úroveň ochrany unikátního ekosystému Pohořského potoka a Jiřické nádrže s původními populacemi střevle potoční a pstruha obecného. V České republice se jedná o jeden z mála systémů, kde střevle přirozeně využívají nejen tekoucí vody (Pohořský potok), ale i vody stojaté (Jiřická nádrž), a to velmi dynamickým způsobem v závislosti na panujících podmínkách.

    Nechránit tuto nádrž je proti všem moderním vědeckým konceptům
    Jiřická nádrž bohužel v současné době postrádá jakýkoliv stupeň efektivní ochrany před nevhodným komerčním využitím. „To, že je tato horská rašelinná nádrž vedena jako obyčejný rybník, je těžko pochopitelné, neboť v kontextu jejího povodí a oživení ohroženými druhy ryb to vůbec neodpovídá realitě,“ shodují se Dr. Jiří Peterka, Prof. Jan Kubečka a Prof. Karel Šimek z Hydrobiologického ústavu Biologického centra (BC) AV ČR. Nezahrnout tuto nádrž do plánované úpravy přírodní památky je podle odborníků proti všem moderním vědeckým konceptům napojení řeka-jezero (rybník), protože prostředím povodí Pohořského potoka a vodních cest je vlastně zajištěna biodiverzita v těchto otevřených a propojených rašelinných ekosystémech. V horní části nádrže se navíc nyní vyskytuje i zvláště chráněný bobr evropský.

    „Je proto zarážející, že tato unikátní nádrž s charakterem přírodního horského jezera, která je centrálním integrujícím prvkem povodí všech rašelinišť v návrhu přírodní památky Pohoří na Šumavě, není do návrhu zahrnuta,“ doplňuje Prof. Jaroslav Vrba z Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích.

    Nepůvodní druhy rybích dravců pustoší původní střevle a pstruhy
    Jiřická nádrž je nyní v pronájmu soukromé firmy. Aktuálně praktikovaný systém komerčního rybolovu narušil křehkou rovnováhu zdejšího ekosystému. Do nádrže byly vysazeny zcela nepůvodní druhy jako sibiřští jeseteři v délce až jeden metr, amuři o váze 8 kg nebo štiky. Zejména štiky jsou schopny se vytřít i v této horské nádrži, nejsou v tomto pstruhovém povodí přirozeným druhem a jsou velmi agresivními predátory, kteří pustoší původní populace střevle potoční a pstruha obecného i v přítocích. Na referenčních lokalitách Pohořského potoka, které Hydrobiologický ústav BC AV ČR dlouhodobě sleduje, již nelze střevli ani spatřit. Navíc všechna voda z Jiřické nádrže je teď odváděna přes výpustní zařízení, a přirozené migrační cesty ohrožených druhů ryb přes přeliv rybníka byly tudíž zcela přerušeny. Přítomnost velkých dravců se negativně dotkne i populací čolka horského, který se hojně vyskytoval v horní části Jiřické nádrže a v přilehlých tůňkách a oddělených původních meandrech Pohořského potoka.

    „Současná umělá rybí obsádka je naprosto nevhodná do prostředí Přírodního parku Novohradské hory, jehož toky odpovídají svým charakterem pstruhovému pásmu. Velké ryby jako jeseteři s délkou až 120 cm a kapři a amuři s váhou až 20 kg nenajdou v prostředí nádrže dostatek přirozené potravy a musí být dokrmovány, což jen zrychluje devastaci původních společenstev ryb, která se v tomto systému vyvíjela po staletí a měla by tudíž být objektem zvýšené ochrany. Vysazování dravců jako je štika do čistě „pstruhových vod“ s velkým podílem ohrožené střevle potoční je dokonce i v příkrém rozporu s pravidly rekreačního rybolovu provozovaného na pstruhových vodách,“ říkají Dr. Peterka a Prof. Jan Kubečka.

    Velmi kontroverzní je i oplocení celé nádrže a přilehlých luk, což znemožňuje přístup k vodní ploše a omezuje turistické využití této jádrové části Přírodního parku Novohradské hory.

    Společenské priority a kvalita vody
    Odborníci rovněž upozorňují na to, že nádrž není izolovaný systém, jako např. louka, ale otevřený krajinný prvek, resp. vodní útvar propojující rozsáhlé povodí chráněných rašelinišť s povodím řeky Malše a přirozené migrační cesty původních druhů ryb.

    Další společenskou prioritou je udržení kvality vody v přítocích řeky Malše a co nejnižšího zatížení vodárenské nádrže Římov fosforem z povodí Novohradských hor. Podobné projekty s dokrmováním nepůvodních druhů ryb zcela zásadně narušují přírodní poměry v povodí dotčeného území v Přírodním parku Novohradské hory a přispívají i ke zvýšenému odnosu fosforu.

    Tištěnou petici je možné podepsat na recepcích Biologického centra AV ČR v Branišovské ulici 31 a v ulici Na Sádkách 7 v Českých Budějovicích, elektronickou ePetici je možné podepsat on-line na Portálu občana https://portal.gov.cz/e-petice/335-petice-za-pripojeni-jiricke-nadrze-do-prirodni-pamatky-pohori-na-sumave-v-navrhu-planu-pece-na-obdobi-20232032.

     

    >Více informací k Petici za připojení Jiřické nádrže do Přírodní památky Pohoří na Šumavě v Návrhu plánu péče na období 2023–2032<

     

    Zdroj: Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

    Kontroly studia za akademický rok 2019/2020

    V termínu od 12. do 23. 10. 2020 probíhají kontroly studia.
    Na studijní oddělení zašlete zápisový list A za 19/20 – naskenovaný/vyfocený s podpisem.

    Svým podpisem stvrzujete, že jsou výsledky vyplněny správně.
    Zápisový list můžete na studijní odd. i přinést.

    Pokud nemáte vyplněny všechny výsledky, kontaktujte příslušného vyučujícího/katedru.

    Krajina, parky, zahrady - na PřF probíhal kurz univerzity třetího věku

    Proběhl další kurz U3V, tentokrát na téma krajina, parky, zahrady a jejich skryté přírodní a kulturní hodnoty. Nechyběla ani závěrečná přednáška o funerální kultuře, aneb podzimní hřbitovy jako netradiční parky.  S velkým úspěchem se také setkaly obě odpolední exkurze. První do Tereziina údolí a druhá do zámeckého parku v Hluboké nad Vltavou.

    Zůstaňme v kontaktu na
    sociálních sítích

    Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

    Branišovská 1645/31a, 370 05 České BudějoviceTel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

    © 2024 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
    Cookies

    1

    0