Sjednocení systematiky sinic pomocí harmonizace polyfázické a genomové taxonomie

Řešitel: Jan Mareš (HBÚ BC)
Spoluřešitel na KBO: Jeffrey R. Johansen
Poskytovatel: Grantová agentura České republiky
Číslo grantu: 22-06374S
Doba trvání: 2022-2024

Po roce 2000 byla vytvořena nová kritéria pro rozpoznávání rodů a druhů sinic pomocí tzv.
polyfázického přístupu. Pomalý průběh revize je však překážkou pro taxonomickou klasifikaci v
metagenomických studiích - proto byly nově zavedeny též některé přístupy genomové
taxonomie. Genomová taxonomie nebyla dosud začleněna do existujícího systému, což
způsobilo zmatek v rámci obou oborů. V projektu porovnáme tyto dva přístupy pomocí
získaných komplementárních dat o modelové skupině Synechococcales, která je již nyní
nejlépe prostudována jak pomocí genomové sekvenace tak polyfázického přístupu. To nám
umožní přímé srovnání a následnou integraci obou přístupů, posouzení hranic mezi taxony, a
navržení taxonomických konceptů pro sinice, které budou přijatelné a použitelné pro všechny
badatele.

Cíle projektu česky
1) Sestavit sbírku kmenů sinic charakterizovaných pomocí polyfázických dat a sekvencí celého
genomu
2) Stanovit taxonomické hranice mezi druhy, rody, čeleděmi a řády pomocí obou přístupů
3) Navrhnout jednotný koncept založený na fylogenomice avšak kompatibilní s existující
taxonomií a nomenklaturou.